病毒病為平菇上的重要病害之一，全國各地普遍發生。平菇菌絲感染病毒後沒有明顯症狀，只是生長速度變緩，菌落邊緣不整齊。到了出菇期，感染病毒的子實體菌柄腫脹呈近球形或燒瓶形，不形成菌蓋或菌蓋很小；有的菌柄變扁或彎曲，表面凹凸不平或有瘤狀突起，菌蓋變小畸形，有深缺刻和呈波浪形；有的菌蓋及菌柄上出現明顯的水漬狀條紋或條斑。
預防平菇病毒病，可採取以下措施：（1）選用無病毒的菌種，嚴格把好母種關。凡生長異常，特別是菌絲不整齊的母種要剔除；原種、生長種在培養階段要經常檢查，凡菌絲有缺刻或花斑塊的要堅決淘汰。（2）菇棚、培養室、接種工具要嚴格消毒。（3）感染病毒病的平菇菌袋要挑出隔離並燒燬。生產結束後對患病的菇房進行嚴格的消毒，將菇床架拆開清洗，防止攜帶病毒的孢子和菌絲潛伏在架縫中。
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