bioRxiv:核苷酸類似物可以抑制SARS-CoV聚合酶

新型冠狀病毒SARS-CoV-2已經造成了全球公共衛生緊急狀況。此前來自哥倫比亞大學的研究人員對丙型肝炎病毒和冠狀病毒複製的機制以及病毒抑制劑的分子結構和活性進行了分析,他們發現FDA批准的丙肝治療藥物EPCLUSA (Sofosbuvir / Velpatasvir)應該可以抑制包括SARS-CoV-2在內的冠狀病毒。

近日,研究人員使用模型聚合酶擴展實驗,證明了Sofosbuvir的三磷酸活化形式可以被低保真聚合酶以及依賴SRAS-CoV RNA的RNA聚合酶(RdRp)進行整合,從而進一步阻止這些聚合酶的活性。

研究人員發現,被激活的三磷酸形式的Sofosbuvir不會被一個類似宿主的高保真度DNA聚合酶整合。利用同樣的分子模擬實驗,研究人員選擇了另外兩種抗病毒藥物,阿洛夫啶和AZT(一種FDA批准的艾滋病藥物)作為SARS-CoV RdRp的抑制劑。研究人員證明了兩種HIV逆轉錄酶抑制劑--3'-氟-3'-脫氧胸腺嘧啶三磷酸和3'-疊氮-3'-脫氧胸腺嘧啶三磷酸(阿洛夫啶和AZT的三磷酸活化形式),能夠被整合到SARS-CoV RdRp中,並終止進一步的聚合酶延伸。

考慮到SARS-CoV和SARS-CoV-2 RdRps具有98%的氨基酸相似性,研究人員認為這些核苷酸類似物也會抑制SARS-CoV-2聚合酶。這些結果為進一步修飾這些核苷酸類似物以產生更有效的廣譜抗冠狀病毒藥物提供了指導。

相關研究成果近日發表在預印本平臺bioRxiv上,題為"Nucleotide Analogues as Inhibitors of SARS-CoV Polymerase"。


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