撰文 | 唐小糖
- 【SARS-CoV-2可以感染CD169+巨噬細胞】
2020年3月31日，第三軍醫大學吳玉章團隊在medRxiv上上傳了一篇研究，通過解剖對6例脾臟（SP）和淋巴結（LN）的檢測，發現SARS-CoV-2可直接感染二級淋巴器官，導致細胞死亡。免疫組化表明明ACE2在SP和 LN的組織常駐CD169+巨噬細胞上表達，免疫熒光染色證實N蛋白可在ACE2+細胞、CD169+巨噬細胞中發現，但不能在CD3+T細胞或B220+B細胞中發現。此外，SARS-CoV-2感染可引起嚴重的組織損傷，包括淋巴濾泡耗竭、脾臟結節萎縮、組織細胞增生和淋巴細胞減少。原位TUNEL染色表明，病毒感染導致嚴重的淋巴細胞凋亡，這可能是由病毒抗原誘導Fas加強調節介導的。此外，SARS-CoV-2還觸發巨噬細胞產生IL-6，意味著可能存在ADE現象，這些結果表明，SARS-CoV-2通過感染組織-駐留CD169+巨噬細胞直接影響人類脾臟和淋巴結。
原文鏈接:https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.03.27.20045427v1
- 【SARS-CoV-2可以感染貓並通過飛沫傳播】
2020年3月31日，中國農業科學院哈爾濱獸醫研究所陳化蘭和步志高團隊在bioRxiv上上傳了一篇研究，研究了幾種動物對SARS-CoV-2的易感性，結果表明在狗、豬、雞和鴨子中病毒複製很差，但在雪貂和貓身上卻能夠有效複製。此外病毒在貓身上還可以通過飛沫進行傳播。該研究為SARS-CoV-2的動物庫及動物管理提供了重要的見解。
原文鏈接:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.30.015347v1
- 【SARS-CoV-2的起源及演化路程】
2020年3月31日，愛丁堡大學AndrewRambaut、格拉斯哥大學病毒研究中心DavidL Robertson聯合賓夕法尼亞州立大學等多個團隊，在bioRxiv上傳了一篇研究，利用遺傳學方法建模，根據HcoV-OC43和MERS-CoV的進化速率分析了SARS-CoV-2的進化路程，結果顯示，SARS-CoV-2與蝙蝠冠狀病毒之間的進化存在三個分歧點，分別在約1948年、1969年和1982年。SARS-CoV-2可能在蝙蝠中傳播數十年後又傳染給其他宿主如穿山甲，這是17年間發生的第三次冠狀病毒爆發，再加上蝙蝠作為宿主的病毒多樣性，很可能還會有其他病毒跨越物種界限，需要引起重視。
原文鏈接:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.30.015008v1
- 【SARS-CoV-2 S蛋白的特異性糖基化位點識別】
2020年3月29日，四川大學華西醫院在bioRxiv上上傳了一篇研究，使用階梯式碰撞能量（SCE）質譜（MS）對SARS-CoV-2S蛋白的位點特異性N-糖基化進行特徵分析。在用兩種相互補充的蛋白酶消化後，分析了SARS-CoV-2S蛋白的N-糖基化圖譜，覆蓋完整的N-糖蛋白和糖基化位點，以及組分和位點特異性糖的數量。所有22種潛在的N-糖基化位點均在S蛋白中鑑定。其中有18種N-糖位在SARS-CoV和SARS-CoV-2S蛋白之間保守存在。在公共數據庫中的753個SARS-CoV-2基因組序列中，幾乎所有糖基化位點都保存了下來。相比之下，昆蟲細胞表達的SARS-CoV-2S蛋白含有38種N-糖，主要是N-甘露糖。而人類細胞表達的蛋白質含有多達140種N-糖，主要屬於複合型。特別注意的是，S蛋白受體結合域中的兩個N-糖基化位點在人類細胞中表現出相對保守的成分。該研究對糖基化位點的分析和確定不同表達系統之間的差異對揭示感染機制有重要提示作用，同時也促進了疫苗和靶向藥物的研發。
原文鏈接:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.28.013276v1
- 【SARS-CoV-2的位點特異性糖基化分析】
糖基化修飾可以遮蔽抗原，幫助抑制免疫原性和進行免疫逃避，識別糖基化對病毒病理學和疫苗設計具有深遠影響。
糖基化位點的數量，埃博拉病毒有8-15個，流感病毒有5-11個，丙肝病毒有4-11個，HIV有20-30個，而SARS-CoV-2的S蛋白共有至少66個糖基化位點，這可能會給疫苗的研發帶來困難。2020年3月28日，牛津大學在bioRxiv上上傳了一篇研究，使用位點特異性的質譜方法，在重組SARS-CoV-2S蛋白免疫原上揭示糖基化結構。該分析能夠映射到整個病毒S蛋白的糖蛋白狀態。結果展示了SARS-CoV-2S蛋白糖基化的特徵，該研究組之前也上傳過SARS-CoV和MERS-CoV的糖基化分析。
原文鏈接:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.26.010322v1
- 【來自駱駝的單域抗體對β冠狀病毒有潛在的中和作用】
2020年3月28日，德州大學奧斯汀分校JasonS McLellan團隊在bioRxiv上上傳了一篇研究，描述了單域抗體（VHHs）的分離和鑑定，VHHs來自於預融合穩定的S蛋白免疫的駱駝。這些VHHs能夠有效中和MERS-CoV或SARS-CoVS假病毒。這些VHHs與各自的病毒靶點結合的晶體結構揭示了兩個不同的表位，但兩個VHHs都封阻了受體結合。作者還展示了SARS-CoVS的VHH和SARS-CoV-2S之間的交叉反應，並證明這種交叉反應有能力中和SARS-CoV-2S假病毒作為人類IgGFc融合。這些數據為VHHS中和致病性β冠狀病毒提供了分子基礎，並表明這些分子在冠狀病毒爆發期間可能被用於作為有效的治療藥物。
原文鏈接:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.26.010165v1
- 【SARS-CoV-2的N蛋白破壞誘導多能幹細胞（iPSC）的多能性】
2020年3月28日bioRxiv上傳的一篇研究通過慢病毒表達系統生成了iPSC過表達SARS-CoV-2的N蛋白（iPSC-nCoVN）。在nCoVN表達兩週後，iPSC的形態和增殖率發生了變化。多能標記SSEA4和TRA-1-81在iPSC-nCoVN中無法檢測到。同時，iPSC-nCoVN在使用常規分化方法時失去了分化成心肌細胞的能力。該數據表明，nCoVN會破壞iPSC的多能特性，並將其轉化為成纖維細胞，這為SARS-CoV-2的致病機制提供了新的見解。
原文鏈接:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.26.010694v1
- 【靶向SARS-CoV-2的Mpro的潛在藥物研究】
2020年3月28日，上海藥物研究所、上海科技大學等多家機構在bioRxiv上傳了一篇研究，設計和合成了兩種針對SARS-CoV-2的Mpro的化合物（11a和11b），兩種化合物均表現出優異的抑制活性，IC50值分別為0.05μM和0.04μM。值得注意的是，這兩種化合物在細胞上均表現出有效的抗SARS-CoV-2感染活性，EC50值分別為0.42μM和0.33μM。SARS-CoV-2Mpro 在11a和11b的複合體中的X射線晶體結構分別以1.5A的分辨率識別。晶體結構表明，11a和11b與Mpro的Cys145不可逆共價結合。這兩種化合物都是有希望的藥物，具有臨床潛力，值得進一步研究。
原文鏈接:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.25.996348v1
- 【脂蛋白核苷酸融合抑制劑抑制SARS-CoV-2膜融合】
2020年3月28日，中國醫學科學院在bioRxiv上傳了一篇研究，首先驗證了SARS-CoV-2使用人類ACE2作為細胞受體，及其S蛋白的膜融合活性。與SARS-CoV相比，SARS-CoV-2的S2融合蛋白中的二次HR1序列具有顯著的穩定性，並且與其相應的HR1位點具有更高的結合親和力。然後，作者設計了一種基於HR2序列的脂蛋白核苷酸融合抑制劑，稱為IPB02，在SARS-CoV-2S蛋白介導細胞-細胞融合和假病毒感染中表現出很高的活性。IPB02還有效地抑制了SARS-CoV假病毒活性。該研究結果為了解SARS-CoV-2的進入途徑和針對膜融合步驟的抗病毒藥物設計提供了重要信息。
原文鏈接:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.26.009233v1
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