bioRxiv:核苷酸类似物可以抑制SARS-CoV聚合酶

新型冠状病毒SARS-CoV-2已经造成了全球公共卫生紧急状况。此前来自哥伦比亚大学的研究人员对丙型肝炎病毒和冠状病毒复制的机制以及病毒抑制剂的分子结构和活性进行了分析,他们发现FDA批准的丙肝治疗药物EPCLUSA (Sofosbuvir / Velpatasvir)应该可以抑制包括SARS-CoV-2在内的冠状病毒。

近日,研究人员使用模型聚合酶扩展实验,证明了Sofosbuvir的三磷酸活化形式可以被低保真聚合酶以及依赖SRAS-CoV RNA的RNA聚合酶(RdRp)进行整合,从而进一步阻止这些聚合酶的活性。

研究人员发现,被激活的三磷酸形式的Sofosbuvir不会被一个类似宿主的高保真度DNA聚合酶整合。利用同样的分子模拟实验,研究人员选择了另外两种抗病毒药物,阿洛夫啶和AZT(一种FDA批准的艾滋病药物)作为SARS-CoV RdRp的抑制剂。研究人员证明了两种HIV逆转录酶抑制剂--3'-氟-3'-脱氧胸腺嘧啶三磷酸和3'-叠氮-3'-脱氧胸腺嘧啶三磷酸(阿洛夫啶和AZT的三磷酸活化形式),能够被整合到SARS-CoV RdRp中,并终止进一步的聚合酶延伸。

考虑到SARS-CoV和SARS-CoV-2 RdRps具有98%的氨基酸相似性,研究人员认为这些核苷酸类似物也会抑制SARS-CoV-2聚合酶。这些结果为进一步修饰这些核苷酸类似物以产生更有效的广谱抗冠状病毒药物提供了指导。

相关研究成果近日发表在预印本平台bioRxiv上,题为"Nucleotide Analogues as Inhibitors of SARS-CoV Polymerase"。


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