海南島及舟山群島解放以後，臺灣成為蔣介石國民黨唯一的存身之地，因此，蔣介石動用其一切政治、經濟、軍事和外交等各方面力量確保臺灣。由於我軍受當時渡海作戰條件的限制和後來國際形勢變化的影響，沒有能夠及時解放臺灣。在第三野戰軍入閩之前，根據革命形勢的變化，為了完成中央軍委所賦予的各項任務及建設現代化的革命軍隊，統一和加強華東地區的軍政領導，華東軍區與第三野戰軍的領導機關於1949年7月合併。
同時，對野戰部隊的機構先後進行了較大調整：第七兵團兼浙江省軍區，該兵團第二十三軍撥歸第九兵團建制，第三十五軍全部地方化；第三兵團部撤銷，大部與華東軍政大學合併，組成新的華東軍政大學，小部與第三十四軍軍部合併組成南京警備司令部，第二十六軍撥歸第九兵團建制：第九兵團第二十、第二十三、第二十六、第二十七軍，準備執行解放臺灣的任務，第三十、第三十三軍調歸淞滬警備司令部建制；第十兵團在福州市解放後，即兼福建省軍區。
左起：葉飛、丁秋生、韋國清、鄧子恢、陳毅、唐亮、粟裕、陳士榘、譚震林。
1950年1月3日，中央軍委決定撤銷第三野戰軍第三十和第三十五軍番號，其成員撥歸華東海軍建制。8月撤銷第三野戰軍前委，組成新的華東軍區黨委，以陳毅為第一書記，粟裕為第二書記，唐亮為第三書記。野戰軍部隊全部歸華東軍區領導。11月，以第二十九軍和第三十二軍軍部組建為鐵道公安司令部。在五大野戰軍存在期間，第三野戰軍是軍建制單位最多的一個野戰軍，有16個建制軍。隨著新中國的建立和革命戰爭任務的完成，為了服從建設新中國和保衛新中國的需要，第三野戰軍部隊發生了很大的變化。
第二十軍：第二十軍參加瞭解放上海的戰役。上海解放後，擔任警衛上海的任務。1951年11月，第二十軍入朝參加抗美援朝戰爭。
第二十一軍：第二十一軍參加瞭解放舟山的戰役。舟山解放後，擔任浙東、浙南和閩北地區的海防任務。1952年3月，第二十一軍參加中國人民志願軍人朝作戰。朝鮮停戰後，參加支援朝鮮人民重建家園的工作：1958年8月回國。
第二十二軍：第二十二軍參加瞭解放舟山的戰役之後，準備參加解放臺灣的渡海作戰。因朝鮮戰爭爆發，解放臺灣的任務停了下來。朝鮮戰爭爆發不久，參加中國人民志願軍人朝作戰。
第二十三軍：參加解放舟山群島的戰役。舟山解放後，準備解放臺灣。朝鮮戰爭爆發後，1952年9月，第二十三軍參加中國人民志願軍人朝作戰。朝鮮停戰後，第二十三軍繼續堅守“三八線”中線陣地，並幫助朝鮮人民醫治戰爭創傷，重建家園。1958年3月撤回國內。
第二十四軍：渡江戰役後不久，該軍暫歸鄂豫皖邊區聯合剿匪指揮部指揮，進剿大別山地區土匪。1950年5月，南進浙西、閩北地區，擔任修建上饒至楊州公路和剿匪任務。1952年9月，參加中國人民志願軍入朝作戰。1955年10月回國。
陳毅,粟裕二位大將,以弱勝強,全殲蔣軍戴之69師
第二十五軍：上海解放後，該軍進至皖南執行剿匪任務。1952年7月20日，中央軍委決定第二十五軍及第七十五師師部調歸空軍，第七十二師調歸第二十二軍，第七十四師調歸第二十四軍，第七十五師各團調歸江蘇軍區，第二十五軍番號撤銷。
第二十六軍：該軍參加上海戰役。上海解放後，擔任警衛上海的任務。1950年1月，第三十軍第八十八師改歸第二十六軍建制。1950年11月，第二十六軍參加中國人民志願軍入朝參戰。1952年6月從朝鮮撤回國內。
第二十八軍：該軍一部參加解放金門島的戰鬥，戰鬥失利後於同年底，駐防福建前線，執行剿匪和守海防的任務。1952年5月，第二十八軍歸福建軍區領導。
第二十九軍。第二十九軍一部參加攻打金門的戰鬥。1950年11月18日，第二十九軍軍部改編為軍委鐵道公安司令部。第八十五、第八十七師調歸福建軍區建制，第八十六師調歸軍委空軍，番號取消。
第三十軍：該軍參加上海戰役。上海解放後擔任淞滬警備任務。1950年1月16日，華東軍區決定第三十軍軍部調歸海軍，所屬第八十八、第八十九、第九十師分別改隸第二十六、第二十、第二十七軍建制，番號取消。
第三十一軍：該軍參加上海戰役。上海戰役結束後，進軍福建，對解放福建省起了重要的作用。1950年5月11日，該軍第九十一師在第九十四師的配合下，解放東山島。1952年5月，歸福建軍區領導。
1950年，張凱（左起）、林維先、王建安、湯光恢、粟裕、張愛萍、唐亮、郭化若、張震在南京。
第三十二軍：該軍未參加渡江作戰。在渡江作戰發起後，該軍在膠東軍區第一00旅的配合下，對青島、即墨地區的國民黨軍隊發起進攻，相繼攻佔即黑、青島。接著，擔任青島市警備任務。1950年2月，第三十二軍調歸第十兵團指揮並由青島南下福建，執行以剿匪為主的海防、警備和作戰任務。同年11月，第三十二軍番號撤銷，軍機關大部充實重建的第八兵團團部，第九十四師調歸第二十七軍建制，第九十五師調歸軍委空軍，第九十六師調歸福建軍區建制。
第三十三軍：該軍參加了上海作戰。上海解放後，擔負吳淞、寶山、嘉定地區的警備任務。7月，第三十四軍第一00師歸第三十三軍建制。1950年11月，第三十二軍奉命改編為華東公安部隊兼淞滬警備司令部，第九十七、第九十八、第九十九、第一00師依次改編為公安第十四、第十五、第十六、第十七師。該軍番號撤銷。
第三十四軍：該軍參加了渡江戰役。南京解放後，進駐南京，擔任警備南京的任務。1949年7月，軍部兼南京警備司令部，袁仲賢任司令員兼政治委員，何以祥、何基灃分任第一、第二副司令員，張藩任副政治委員，饒子健任參謀長，王德貴任政治部主任。1950年1月，第三野戰軍教導師6個團調歸第三十四軍兼南京軍區警備司令部建制。同時，軍機關一部組建華東軍區航空處。11月，軍機關及其餘部隊改編為華東公安第十三師。第三十四軍番號撤銷。
第三十五軍：該軍原是由魯中南縱隊和由濟南戰役中起義的吳化文部合編而成的。該軍參加了渡江戰役。之後，南下浙江金華地區執行剿匪任務。1949年9月，該軍第一0三、第一0四、第一0五師分別兼衢州、紹興軍分區和杭州警備區。1950年1月，第三十五軍番號撤銷，軍部及軍屬炮兵團調歸華東海軍。
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