成吉思汗於1206年，在斡難河源，建立了蒙古帝國。之後，成吉思汗開始征伐西夏、金、西遼等國。經過成吉思汗、窩闊臺汗和蒙哥汗的三次西征，蒙古帝國的疆域達到了巔峰，約2400萬平方公里。
1259年，蒙哥汗去世，第二年，忽必烈和阿里不哥爭奪汗位，蒙古帝國開始走向分裂。1264年，忽必烈擊敗了阿里不哥，可是，忽必烈的繼承資格，並沒有得到蒙古諸王的一致承認。此時，原屬蒙古帝國的朮赤、察合臺、窩闊臺、旭烈兀等四王，分別在自己的封底上獨立，被稱為四大汗國。
到了1271年，忽必烈改國號“大元”，自稱“蒙古大汗”。之後，忽必烈滅亡了南宋，控制了中國的大部分地區。元朝，加上之前處於獨立狀態的四大汗國，其中包括朮赤之子拔都建立的金帳汗國（又稱欽察汗國），察合臺建立的察合臺汗國，窩闊臺建立的窩闊臺汗國，旭烈兀建立的伊兒汗國（又稱伊利汗國），被並稱為“五大汗國”。
其他還有一些小的汗國，分別依附於五大汗國，都是附庸關係，可以忽略不計。
窩闊臺汗國
五大汗國中，窩闊臺汗國最弱小，也最先滅亡。1309年，元朝和察合臺汗國，將窩闊臺汗國瓜分，窩闊臺王投奔元朝，窩闊臺汗國滅亡。蒙古五大汗國，重新回到了四大汗國。
元朝
元朝是第二個滅亡的汗國。1368年，明朝將元朝趕回了蒙古草原。元惠帝繼續使用了“大元”的國號，歷史上被稱為北元。北元在大明軍隊的多次打擊之下，1388年，北元退至捕魚兒海（今天的中蒙邊境貝爾湖）。明朝大將藍玉率十五萬明軍，大破之，俘虜八萬餘人。1402年，窩闊臺後裔鬼力赤殺死元帝，去“大元”國號。此後，北元餘部被稱為“韃靼”。
1634年，女真擊敗韃靼部落，歸入了後金。皇太極繼位後，改國號後金為清。明朝的疆土最後也被清朝佔領。所以，元朝最終歸入了大清，也就是中國了。
伊兒汗國
伊兒汗國（伊利汗國），因為是忽必烈的兄弟，所以，一直站在元朝一方。
該汗國的主要疆域位於現在的伊朗、伊拉克、阿塞拜疆、阿富汗西部、土耳其的部分疆域。
1335年後，伊兒汗國分裂為了多個王朝，主要包括穆扎法爾王朝、札剌亦兒王朝、丘拜尼王朝（又名楚邦王朝）、賽爾別達爾國等。
1355年，欽察汗國滅丘拜尼王朝。1393年，由突厥化的蒙古人建立的帖木兒帝國滅亡了札剌亦兒王朝。此後，伊兒汗國徹底歸入了帖木兒帝國。
欽察汗國
欽察汗國核心地區在伏爾加河流域，主要佔據東歐和中歐地區，一直到多瑙河流域。
1480年，欽察汗國可汗阿合馬死於內亂，整個汗國開始分崩離析，莫斯科公國趁機獨立。1502年，克里木汗國滅亡欽察汗國。直到1783年，莫斯科公國先後打敗了從欽察汗國分裂出來的喀山汗國、阿斯特拉罕汗國、西伯利亞汗國及克里木汗國，自此，欽察汗國的主要疆域歸入了俄羅斯沙皇國。
察合臺汗國
察合臺汗國，主要位於我國新疆天山南北、西藏，以及現在的吉爾吉斯、塔吉克、哈薩克、烏茲別克、土庫曼等五個中亞國家。
1346年，察合臺汗國分裂為東西兩部分。
西察合臺汗國，在1369年，被帖木兒帝國滅亡。
東察合臺汗國，在現在的新疆區域，曾經奉明朝為宗主國。清朝時的1680年，東察合臺汗國被準噶爾汗國滅亡，後歸入清朝。
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