文 | 小文
預印本網站medRxiv和bioRxiv最新更新4篇論文，主要內容為：
復旦大學等機構的研究人員基於實驗得到的SARS-CoV S-RBD-ACE2複雜結構，進行了大規模蛋白-蛋白對接，從而量化了2019-nCoV S-蛋白受體結合域（S-RBD）與人受體ACE2的相互作用；
中山大學的研究人員進行了利托那韋和洛匹那韋對武漢肺炎冠狀病毒作用靶點的分子模擬評估；
美國哥倫比亞大學等機構研究人員發現2019-nCoV（武漢冠狀病毒）的高區分度的氨基酸序列，並分析了季節性冠狀病毒的無症狀感染率測量與臨床護理尋求。
注意：預印本網站medRxiv和bioRxiv的所有論文未經同行評議。
bioRxiv
評估2019年新型冠狀病毒（2019-nCoV）的人類受體結合能力
2002-2003年SARS、2012-2015年MERS以及2019-2020年武漢呼吸綜合徵的暴發清楚表明，動物冠狀病毒（CoV）的基因組進化可能使其獲得人類傳播能力，從而對全球公共健康造成嚴重威脅。
人們普遍認為，冠狀病毒的人類傳播是由其突刺蛋白（S蛋白）與宿主細胞表面上的人類受體的相互作用引起的。
因此，對這些相互作用的定量評估可用於評估CoV的人類傳播能力。
但是，目前仍然缺乏直接使用病毒基因組數據的定量方法。
復旦大學等機構的研究人員基於實驗得到的SARS-CoV S-RBD-ACE2複雜結構，進行了大規模蛋白-蛋白對接，從而量化了2019-nCoV S-蛋白受體結合域（S-RBD）與人受體ACE2的相互作用。
通過使用蒙特卡洛算法對大量熱力學上可能的結合構象進行採樣，該方法成功地將實驗來源的複合物結構鑑定為最低能量的受體結合構象，從而建立了基於實驗的強度參考，可用於評估與SARS-CoV相比之下2019-nCoV受體的結合親和力。
結果表明，這種結合親和力約為SARS-CoV的73％，這表明2019-nCoV可能導致與SARS-CoV相似的人類傳播。
因此，這項研究提出了一種快速評估新出現CoV及其突變株人類傳播能力的方法，並證明了蛋白質-蛋白質相互作用的後基因組分析可為病毒的預防和控制提供早期科學指導。
作者：Qiang Huang, Andreas Herrmann
相關論文信息：
Fast assessment of humanreceptor-binding capability of 2019 novel coronavirus (2019-nCoV)
DOI: 10.1101/2020.02.01.930537
利托那韋和洛匹那韋對武漢肺炎冠狀病毒作用靶點的分子模擬評估
一種由兩種蛋白酶抑制劑，利托那韋和洛匹那韋組成的抗HIV藥物Kaletra，對武漢肺炎等冠狀病毒疾病可能具有治療作用。
通過同源性建模，中山大學的研究人員建立了兩種武漢肺炎冠狀病毒蛋白酶：冠狀病毒內肽酶C30和木瓜蛋白酶樣病毒蛋白酶的結構模型，然後分別將利托那韋和洛匹那韋對接到蛋白酶模型上。
在所有模擬中，利托那韋和冠狀病毒內肽酶C30之間的結合最為合適。
另外，與木瓜蛋白酶樣病毒蛋白酶相比，利托那韋和洛匹那韋似乎都更適合結合冠狀病毒內肽酶C30。
根據這些結果，研究人員認為Kaletra對武漢肺炎的治療作用可能主要歸因於利托那韋對冠狀病毒內肽酶C30的抑制作用。
作者：Shen Lin, Runnan Shen, Xushun Guo
相關論文信息：
Molecular Modeling Evaluation of theBinding Abilities of Ritonavir and Lopinavir to Wuhan Pneumonia CoronavirusProteases
DOI: 10.1101/2020.01.31.929695
研究發現2019-nCoV的高區分度的氨基酸序列
通過使用DNA合成順序的病原體篩選方法，來自美國Raytheon BBN技術公司的研究人員確定了一些氨基酸序列，能夠將2019-nCoV（武漢冠狀病毒）與冠狀病毒科中的所有其他已知病毒區分開來。
研究人員發現了三個具有獨特序列的主要區域：兩個在1ab多聚蛋白QHO60603.1中，一個在表面糖蛋白QHO60594.1中。
作者：Jacob Beal, Thomas Mitchell, DanielWyschogrod, Jeff Manthey, Adam Clore
相關論文信息：
Highly Distinguished Amino AcidSequences of 2019-nCoV (Wuhan Coronavirus)
DOI: 10.1101/2020.01.31.929497
medRxiv
季節性冠狀病毒的無症狀感染率測量與臨床護理尋求
2019年12月在中國武漢出現的新型冠狀病毒（nCoV）大流行潛力與潛在人類感染的數量和傳染性密切相關。
美國哥倫比亞大學的研究人員從急性病毒性呼吸道感染的主動縱向採樣研究中得出結果，這些感染記錄了無症狀感染率和季節性冠狀病毒的臨床護理。
研究人員發現大多數感染是無症狀的，並且只有4％出現了季節性冠狀病毒感染的人會因為症狀的出現而尋求醫療服務。
這些數字表明，高比例的季節性冠狀病毒感染沒有被記錄過，這也為了解新興nCoV的傳播提供了參考。
作者：Jeffrey Shaman, Marta Galanti
相關論文信息：
Direct Measurement of Rates ofAsymptomatic Infection and Clinical Care-Seeking for Seasonal Coronavirus
DOI: 10.1101/2020.01.30.20019612
閱讀更多 科學網 的文章
