2月8日，預印本網站medRxiv和bioRxiv更新3篇新冠病毒相關論文，主要內容如下：
注意：預印本網站bioRxiv的所有論文未經同行評議。
medRxiv
結腸上皮細胞的ACE2表達與病毒感染、免疫力和能量代謝有關
由2019新型冠狀病毒（2019-nCoV）肺炎引起的呼吸道疾病於2019年12月在中國湖北省武漢市首次出現，並迅速傳播到其他省份和其他國家。
血管緊張素轉換酶2（ACE2）是SARS-CoV的受體，並被認為也是2019-nCoV的受體。
矛盾的是，肺中ACE2的表達通過減弱腎素-血管緊張素系統而保護小鼠免受SARS-CoV刺突蛋白誘導的肺損傷；在腸中，ACE2還通過維持氨基酸穩態、抗菌肽的表達和腸道微生物組的生態來抑制腸炎症。
通過分析來自對照受試者和患有結腸炎或炎性腸病（IBD）受試者的單細胞RNA測序數據，廣州醫科大學的研究人員發現結腸細胞中ACE2的表達與調節病毒感染、先天和細胞免疫的基因呈正相關，但呈負相關具有病毒轉錄、蛋白質翻譯、體液免疫、吞噬作用和補體激活。
總之，研究人員認為ACE2在介導2019-nCoV感染的易感性和免疫性中可能起雙重作用。
作者：Jun Wang, Shanmeizi Zhao, Ming Liu,Zhiyao Zhao, Yiping Xu, Ping Wang, Meng Lin, Yanhui Xu, Bing Huang, Xiaoyu Zuo,Zhanghua Chen, Fan Bai, Jun Cui, Andrew M Lew, Jincun Zhao, Yan Zhang, HaibinLuo, Yuxia Zhang
相關論文信息：ACE2 expression by colonicepithelial cells is associated with viral infection, immunity and energymetabolism
DOI: 10.1101/2020.02.05.20020545
非洲國家應為新冠病毒的傳播做好準備
新型冠狀病毒（2019-nCoV）流行已從中國擴散到23個國家。
病例輸入後，已有7個國家發生了本地傳播。
沒有非洲國家報告過病例。
2019-nCoV輸入的管理和控制在很大程度上取決於一個國家的公共衛生能力。
法國國家健康與醫學研究院等機構等機構的研究人員評估了非洲國家針對其2019-nCoV輸入風險的防範和脆弱性。
研究人員使用了從中國感染省份的機場出發並飛往非洲的航空旅行量的數據來估計每個國家引入的風險。
研究人員用兩個指標確定了國家發現和應對病例的能力：世衛組織《國際衛生條例監測和評估框架》定義的準備情況，以及傳染病脆弱性指數定義的脆弱性。
根據中國地區對風險的貢獻最大，將國家分組。
調查結果表明，進口風險最高的國家（埃及、阿爾及利亞、南非共和國）對疫情爆發具有中等至高能力。
處於中等風險的國家（尼日利亞、埃塞俄比亞、蘇丹、安哥拉、坦桑尼亞、加納、肯尼亞）有不等的能力，脆弱性高。研究人員確定了三類國家，它們分別承受來自廣東、福建和北京等地區的相同風險。
因此，非洲的一些國家正在加緊準備，以發現並應對2019-nCoV的輸入。
資源和強化監控應優先在中等風險國家中考慮，這些國家可能不足以應對病毒的輸入和限制其繼續傳播。
作者：Marius Gilbert, Giulia Pullano,Francesco Pinotti, Eugenio Valdano, Chiara Poletto, Pierre-Yves Boelle, EricD'Ortenzio, Yazdan Yazdanpanah, Serge Paul Eholie, Mathias Altmann, BernardoGutierrez, Moritz U. G. Kraemer, Vittoria Colizza
相關論文信息：Preparedness and vulnerability ofAfrican countries against introductions of 2019-nCoV
DOI: 10.1101/2020.02.05.20020792
bioRxiv
研究人員開發冠狀病毒數據庫
最近暴發的一種新型動物來源冠狀病毒為潛在的流行性冠狀病毒跨物種傳播敲響了警鐘。
目前迫切需要協助控制冠狀病毒傳播並提供有價值的科學信息，重慶大學等機構的研究人員開發了冠狀病毒數據庫（CoVdb），一個在線基因組學和蛋白質組學分析平臺。
根據公開訪問的冠狀病毒基因組信息，該數據庫註釋了每個菌株的基因組，並鑑定了Genebank中所有可用菌株中780個可能的ORF。
此外，CoVdb還對冠狀病毒菌株的所有已發佈基因組進行了全面評估，包括歷史和全球範圍內的種群遺傳學分析、功能分析和結構分析。
在該數據庫中，研究人員可以輕鬆地獲得冠狀病毒基因的基本信息，包括該基因在菌株之間的分佈、保守或高突變區域、基因可能的亞細胞位置和拓撲結構。
此外，也提供了用於人口遺傳學分析結果的滑動窗口，從而促進了基因組水平的遺傳學和進化分析。
可以從http://covdb.popgenetics.net免費訪問CoVdb。
作者：Zhenglin Zhu, Kaiwen Meng, Geng Meng
相關論文信息：A database resource for Genome-widedynamics analysis of Coronaviruses on a historical and global scale
DOI: 10.1101/2020.02.05.920009
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