黃龍地區地貌總體特徵是山雄峽峻。其特點是，角峰如林，刃脊縱橫；峽谷深切，崖壁陡峭；枝狀江源，南直北曲。黃龍高程範圍在海拔1700～5588米，一般峰谷相對高差千米以上，3700～4000米以上多為冰蝕地貌，氣勢磅礴，雄偉壯觀。黃龍多喀斯特峽谷，空間多變，崖峰峻峭，水景豐富，植被繁茂。依谷底形態分，有丹雲喀斯特溪峽，扎尕鈣華森林峽和二道海鈣華疊湖峽等數種。黃龍境內涪江江源為一主幹東西樹枝狀水系，上游河床寬平，下游峽谷深曲，南側支流平直排列，北側支流陡曲排列，形成上寬下深、南直北曲的獨特江源風貌。
黃龍在空間位置上處於單元間的交接部位。構造上它處在揚子準臺地、松潘一甘孜褶皺系與秦嶺地槽招皺系三個大地構造單元的結合部，地貌上屬中國第二地貌階梯坎前位，青藏高原東部邊緣與四川盆地西部山區交接帶。風景區內，又為東西向雪山斷裂，虎牙斷裂和南北向岷山斷裂，扎尕山斷裂，交叉切錯，而且黃龍本部與牟尼溝景區在巖性、層序、沉積等古地理條件和地層構造、構造形跡上均有較大差異。
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