獨樹村建於1500多年以前的北魏時期。北魏的酈道元著的《水經注》稱獨樹水（即今南泉水河）。
2019年12月25日，被評為國家森林鄉村。雲居寺內唐代石經題記，獨樹村名字見於雲居寺內唐代石經題記中。該村是大石窩鎮一箇中等村，全村210戶，678口人，有黨員27名，村域面積1709畝，耕地684畝。一說起漢白玉，人們可能首先想到的是大石窩村。但是，最早開採漢白玉的村子卻是大石窩鎮一座古老的村落——獨樹村。戰國時期，已經有了這個村子。
漢武帝雄才大略，非常之人，非常之功。歷史學家評說：“冠於百王”，是“我國二十四朝之皇帝”，對中國歷史影響久遠。
《史記·孝武本紀》：“其明年上郊雍，通回中道，巡之。春至鳴澤，從西河還。”《漢書》：“（元封）四年……遂北出蕭關，歷獨鹿、鳴澤，自代而還。”偌大的華北，司馬遷、班固為什麼僅僅寫獨鹿、鳴澤，看來自有奇異獨特的地方，令漢武帝徘徊不忍去。獨鹿、鳴澤（獨樹裡北面鄰村）
獨樹村目前村北和村西還有兩千多年前的漢白玉開採遺蹟，分別叫大塘口和小塘口，比大石窩漢白玉塘要早一千四百多年。所以是大石窩鎮的獨樹村開啟了兩千多年漢白玉開採的文化歷史和豐富燦爛的漢白玉文化。
元代建大都，大都有一個機構全稱是逐鹿金玉匠人總管府，簡稱金玉府。金玉府的提領張斌是獨樹村人，獨樹人參與了元大都的建設。應該說獨樹開採開啟了一段北京文明史上重要的篇章，明代獨樹石場仍然運作，直至清代晚期，建慈禧陵仍然用的獨樹村的石材，承包商建完了還特地建了山神廟。
隋代房山開始刻經，獨樹村成為刻經基地。貞觀五年，靜琬創建雲居寺，獨樹村採石場更多是在隋唐時期採石刻經用，這裡開啟了漢白玉大規模開採使用之先河。房山石經裡，有若干個獨樹村先民捐資刻經的記載，我們可以追憶，獨樹先民和雲居寺的這種紐帶關係，足以見證獨樹村對雲居寺的貢獻。
兩千多年的滄桑變遷，在如火如荼的美麗鄉村建設中，獨樹村的面貌發生了翻天覆地的變化。這裡自然環境優美，得天獨厚；這裡遠離交通主幹線，村前是河，村西是河，村後依靠大山，還有林木覆蓋，溪流潺潺，確是一座離沉脫世的好地方。雖然千年已過，但是守望互助，淳樸天然的傳統美德依然在這裡流傳，質樸的村民們將這裡逐步建成了和諧穩定、宜居樂業的幸福村莊。
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