間變性淋巴瘤激酶（ALK）突變是非小細胞肺癌（NSCLC）常見的兩種基因突變形式之一，據統計約有5%的NSCLC患者存在著ALK基因重排，在肺腺癌、年輕患者以及不吸菸人群中比例更高，這類突變定義了NSCLC的一類獨特的分子亞型。更重要的是，ALK突變被認為是“鑽石突變”，相較EGFR基因突變的靶向治療，ALK抑制劑的作用效果更顯著。
隨著檢測方法的進步和研究的深入，研究者發現ALK突變可以細分為不同類型，除了經典的ALK-EML4融合突變之外，還發現了其他的融合伴侶，不同的融合突變給以克唑替尼為代表的靶向治療帶來了巨大的挑戰。之前，我們分享了許多ALK基因突變亞型的治療經驗，近期，我國中山大學附屬第一醫院團隊在《JTO》雜誌發表的一篇文章，報道了又一例克唑替尼對新型ALK融合突變肺腺癌患者的治療效果。
案例報道
這是一位61歲的中國男性患者，CT檢查發現患者肺門處存在一個不規則結節，之後患者進行了組織活檢和影像學檢查確認，確診為IIIB期肺腺癌。
在還未進行標準治療的情況下，醫生先對該患者的處理好的組織樣本進行新一代測序（NGS）檢查，以便發現最初腫瘤的基因突變。結果顯示，患者21號染色體長臂的21.1的Linc00308/D21S2088E基因間區域與2號染色體短臂的ALK的內含子19融合產生了一種新的融合突變。DNA測序結構顯示，融合轉錄由此基因區間和ALK基因20-29外顯子組成，後者完整編碼了ALK胞內激酶結構域。之後患者通過T-PCR和Sanger測序在RNA層面驗證了該新ALK基因融合突變。並且患者在接受克唑替尼治療前，通過常規FISH檢測和免疫組化對組織樣本進行了重新確認。
經過一系列的檢查，患者開始每日兩次的口服250 mg的克唑替尼進行治療。四個月後，CT掃描顯示，靶病灶腫瘤明顯縮小，瘤體最大直徑從2.93mm降至1.92mm，六個月時病情仍有緩解。外周血的循環腫瘤細胞（CTC）檢查顯示，與基線時CTC水平(13/mL)相比，治療4個月CTC數量顯著下降，並且在4個月內（2019年4月~2019年8月）保持在1/mL。重複循環腫瘤DNA（ctDNA）分析提示，突變的基因頻率與腫瘤符合密切相關，能準確的反應出克唑替尼對腫瘤組織的控制效果。目前，克唑替尼仍有良好的耐受性。此外進一步研究顯示，克唑替尼可顯著抑制從肺腺癌新鮮腫瘤組織中分離出的Y1507和Y1604位點的ALK磷酸化，且患者ALK陽性腫瘤細胞在體內和體外均對克唑替尼治療高度敏感。
進一步研究證實克唑替尼對此型ALK融合突變有效
僅通過單個病例得出“克唑替尼對Linc00308/D21S2088E-ALK融合突變有效”這一結論似乎並不嚴謹，研究者為了進一步評估這種新型ALK融合蛋白在腫瘤發生中的作用，通過基因工程技術將可表達該新型ALK融合蛋白的質粒轉染到實驗細胞（Ba/F3細胞）當中。這種Ba/F3細胞與其他細胞不同之處在於，其生長需要依賴一種白介素-3（IL-3）的物質，IL-3缺乏的情況下，其生長會受到一定影響。但在缺乏IL-3的情況下，可以表達新型ALK融合蛋白的Ba/F3細胞卻以指數速度增長，這與癌細胞的生長方式相符，從而證實了這類新型ALK蛋白的激酶依賴性致癌活性。
研究證實，有多個融合伴侶可促進ALK激酶的自磷酸化並增加致癌潛能，最常見的EML4–ALK融合突變就是如此。在此次報道中，研究者發現了位於Linc00308/D21S2088E(兩個非編碼基因)基因間區域的ALK新型融合伴侶的存在，還證實了此種融合可增強ALK激酶活性並可激活下游的效應因子的磷酸化，由此，我國有一次擴大了ALK融合基因突變頻譜，並且提供了克唑替尼治療
Linc00308/D21S2088E-ALK融合突變可能有效的證據，對之後優化治療策略有著重要的意義。
