外貿企業的採購貨物專用發票是退稅憑證，認證後一定不能抵扣，那到底如何處理才算規範呢？
1、外貿企業出口退稅以進貨專用發票（國內採購貨物）和進口增值稅繳款書（國外採購貨物）為依據。專用發票是退稅憑證，不是抵扣憑證；如果進項稅抵扣了再申請退稅，就是“一票二用”。
2、外貿企業取得專用發票要勾選退稅，若誤勾成抵扣，需要調整為“退稅勾選”的，按以下規則處理：
（一）若應勾選為退稅的數據錯誤勾選為抵扣，但該發票尚未用於納稅申報的，應按以下規則處理：
1.已“抵扣勾選”數據尚未“申請統計”的，納稅人可以自行將用途調整為退稅：取消原勾選，再在“退稅勾選”中進行勾選。
2.“抵扣勾選”數據已經“申請統計”但尚未“確認簽名”的，納稅人應先撤銷統計，然後取消原勾選，再在“退稅勾選”中進行勾選。
3.“抵扣勾選”數據已“確認簽名”但尚未進行納稅申報的，企業應先撤銷“確認簽名”並撤銷統計，然後取消原勾選，再在“退稅勾選”中進行勾選。
（二）若應勾選為退稅的數據錯誤勾選為抵扣，且該發票已納稅申報的，應按以下規則處理：
納稅人申請將已經納稅申報的“抵扣勾選”發票調整為“退稅勾選”的，首先應將相應稅款從進項稅額中轉出。然後向主管徵稅稅務機關提出《進項稅額轉出核實函》申請。
總體來說，納稅人每張發票只能進行一次內銷轉出口業務，即一張發票從“抵扣勾選”調整為“退稅勾選”只能操作一次。
另外，既有內銷又有出口的外貿企業，採購商品取得供貨商發票時，一定讓供應商分別開具。
內外銷業務開在一張發票上麻煩很多。因為根據財稅2012年 39號通知的規定，外貿企業應單獨設賬核算出口貨物的購進金額和進項稅額，若購進貨物時不能確定是用於出口的，先記入出口庫存賬，用於其他用途時應從出口庫存賬轉出。而且這個轉出還需要經過稅局辦理《出口轉內銷證明》或《誤勾退稅且未申報退稅證明》，增加很多工作量。
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