根據《中華人民共和國企業所得稅法實施條例》（中華人民共和國國務院令第512號）第四十條規定：“企業發生的職工福利費支出，不超過工資、薪金總額14%的部分，准予扣除。”
另根據《國家稅務總局關於企業工資薪金及職工福利費扣除問題的通知》（國稅函〔2009〕3號）規定：“三、關於職工福利費扣除問題
《實施條例》第四十條規定的企業職工福利費，包括以下內容：
……
（二）為職工衛生保健、生活、住房、交通等所發放的各項補貼和非貨幣性福利，包括企業向職工發放的因公外地就醫費用、未實行醫療統籌企業職工醫療費用、職工供養直系親屬醫療補貼、供暖費補貼、職工防暑降溫費、職工困難補貼、救濟費、職工食堂經費補貼、職工交通補貼等。
（三）按照其他規定發生的其他職工福利費，包括喪葬補助費、撫卹費、安家費、探親假路費等。”
因此，職工的體檢費應計入職工福利費，按照職工福利費的標準進行扣除。
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