有人說“膽結石是由膽固醇結晶進一步發展而來”，其實，這隻說對了一半。膽結石按照其化學成分分為膽固醇結石（約佔50%）、膽色素結石（約佔30%）和混合性結石三類。膽囊結石以膽固醇結石為主，膽管結石則以膽色素結石多見。而膽固醇結石的確是由膽固醇結晶進一步發展而來。
膽結石形成的原因非常複雜，如年齡增長、性別、種族、基因和家族史等，這些是不可更改的，稱不可逆因素；而對於妊娠，肥胖，低纖維、高熱量的飲食結構，長時間禁食，某些藥物如降脂藥、避孕藥，快速體重喪失（>1.5千克/周），代謝綜合徵及特殊疾病等，這些則是可以逆轉的，稱可逆因素。
研究發現膽結石的發病高峰人群在40歲～50歲；男女發病之比約為1：2。女性膽囊結石以膽固醇結石多發；妊娠可促進膽囊結石的形成，並且妊娠次數越多，得膽囊結石概率越大。肥胖人膽結石發病率為正常體重人群的3倍；某些藥物可以導致膽囊結石的形成，但如果用藥時間短，結石可以消失。快速體重喪失（>1.5千克/周），如不合理的減肥方法，可以導致膽囊結石的形成。代謝綜合徵如糖尿病、高脂血症患者，膽囊結石的發病率明顯升高；還有一些特殊疾病，例如甲狀旁腺疾病導致的鈣磷代謝異常等也可以引起膽結石的發病。
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