关于载沣摄政不久，就下谕罢免袁世凯，其原因有各种记载见诸于野史、笔记、研究文章中。
说法之一，是载沣为完成胞兄载湉之遗嘱，除袁世凯为其报戊戌之遗恨。至于光绪是以何种形式嘱托于载沣，说法亦各异。有云光绪临终拉着载沣的手，叫他杀袁世凯；有云光绪遗孀隆裕在光绪故后，在其砚台盒内，发现了光绪亲用朱笔所写的“必杀袁世凯”的手谕，隆裕因而面谕载沣，杀袁世凯报仇。这些传闻没有切实可靠的证据，不能说其无，也不能肯定必有。
其实不单载沣想奉旨杀袁，想杀袁而后快的朝中权贵大有人在！比如载泽，倒未必有什么世仇未报，主要是袁世凯的军权在握，实在令人眼热，往国家意义上来说，这是不稳定因素，按个人因素来说，谁都想控制军政大权，最最重要的是-袁世凯是个汉人。
袁世凯是在戊戌政变中出卖维新派起家的汉族官僚，他手握重权、掌管新军，北京周围新建的陆军一共六镇，其中五镇是袁世凯的部队。东三省、直隶、山东的巡抚、总督大多是袁世凯的心腹亲信。他控制着清政府北方的军政大权，又和庆亲王奕劻金钱勾结，因此他早就被皇族少年亲贵视为大逆不道。袁世凯一旦乱国不可收拾，而且能钳制袁世凯的慈禧太后已死，兵权在握的袁世凯是小皇帝溥仪的极大威胁。更有甚者密告载沣，袁世凯有心拥立隆裕太后垂帘听政，要把摄政王赶下台。因此无论从何种角度看，载沣都得除掉袁世凯报兄仇、绝后患。
袁世凯手里掌握着如此重要的军事力量，显然，直接杀袁世凯必然不是最好的选择，否则很可能会控制不住军队。但是，载沣又不得不对付袁世凯，只要将袁世凯压下去了，那么他自己的威信便上来了。载沣对付袁世凯，既是为了收权，也是为了立威。
因此，载沣最后选择罢免袁世凯的官职。袁世凯想了想，也没有反对载沣的决定，因为他确信即使自己离开台面，可是在背后，他仍然是北洋新军的主导者，顺便陪载沣玩玩“以退为进”。
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