大學生思想政治工作體系雖非我國獨創，卻是現在區分我國高等教育體制和西方高等教育體制的一個明顯形式。從系統論的觀點來看，大學生思想政治工作系統的上一級系統是高等教育，因此，大學生思想政治工作要服從和服務於我國的高等教育規律。而我國高等教育也有著自身的特色，大學生思想政治工作就是其中的特色之一。
但是，當前大學生思想政治教育存在三個十分嚴重的問題。第一是主渠道（思想政治理論課）不暢，主要表現在教學內容陳舊，教學方法過時，教學手段落後，對學生缺乏吸引力和說服力。第二是主陣地（第二課堂）不牢，主要表現在第二課堂缺乏系統設計，活動經費緊張，活動數量偏少和規模偏小，使參與學生人數偏少；第三是新陣地（網絡思想政治教育）不吸引人，主要表現在網頁設計過於嚴肅和呆板，在線即時交流欠缺，內容偏於理論說教和日常事務處理。這些問題往往又被相關工作者歸因於“現在的大學生思想複雜，不好教和不好管”而忽略，一部分教師甚至拒絕反思大學生思想政治教育為什麼遭到學生排斥甚至反感的自身原因。
我國改革開放30年來，高等教育面臨的形勢與挑戰發生了巨大變化，國家在和平崛起，國際環境在日漸好轉，世界秩序在向多極化轉移，科學技術在突飛猛進，大學生的求知渠道日漸開闊、獲取信息日漸迅捷……因此，大學生思想政治工作的功能也應該做出與時俱進的調整，因時而動成為勢所必然。“導向功能、政治功能、文化功能、激勵功能和調適功能”是當前大學生思想政治工作的主要功能。在多元價值觀激烈衝撞、網絡技術正在改變生活的當今世界，採用灌輸型、經驗型、共性化、平面化的教育策略在節約了教育成本的同時也降低了教育效果、失去了教育質量。現在，我們必須思考如何通過引導型、開放型、科學型、個性化、立體化的教育方法，首先幫助學生獲得嚴謹的思考方法，然後引導他們自主的在問題、興趣和探究中廣泛學習，從而在思想上、政治上、文化上、心理上成為具有全面發展追求的現代人，成為高級的社會主義事業的建設者。
顯然，這是大學生思想政治工作的巨大轉型，它要求我們擺脫“頭疼醫頭、腳疼醫腳”的滅“火”方式，擺脫“以我為主、居高臨下”的說教方式，擺脫“指手畫腳，說一不二”的命令方式，擺脫“發文佈置工作，開會傳達精神”的脫責方式；也要求我們堅持“以人為本”的服務觀念，採用“學生喜聞樂見”的現代工具，運用“新瓶裝舊酒（新瓶是指新的大學生感興趣的活動形式，舊酒是指人類文明的優秀文化積澱和精神財富）”的活動形式，依託時代熱點，追蹤學生特點，注重學生個性發展，以理服人，以情動人，以心交心，以智慧為學生導航。
