永徽六年(公元655年)十月，高宗以“陰謀下毒”的罪名，將王皇后和蕭淑記廢為庶人，並加以囚禁，還削去她們的父母、兄弟等人的官職，將他們流放嶺南。七天後，唐高宗再次下詔，將武媚娘立為皇后。高宗決定為武媚娘舉行隆重的封后大典，並讓她在肅儀門的城樓上接受百官朝賀，令朝臣真正接受武媚娘為後。這一舉措出乎眾臣的意料，因為皇后受朝賀還真屬罕見之事。不過皇命難違，眾臣即使不情願也只能按要求跪拜，高呼“皇后萬壽無疆”。第二年，又廢掉了原來的太子而改立武后之子李弘為太子。
至此，32歲的武媚娘終於完成了自己的理想，在她從一名普通民間女子走上皇后之位的過程中，經歷了許多坎坷與磨難，同時也付出了很大的代價。
高宗生性多愁善感，性格優柔寡斷，有一天，他突然懷念起王皇后與蕭淑妃，便讓宦官領路，打算去別院看望她們。當他看到王皇后與蕭淑妃的悲慘境況之時，心中頓時升起無限憐憫，並且答應過幾天再來看她們。
武后知道此事，心中大怒，打算搶在高宗因惻隱之心放她們出來之前處死這兩個心腹之患。幾天後，武后派人來痛斥二人無心悔過，還要迷惑皇上，罪加一等，罰二人各杖責一百，直打得她們皮開肉綻。最後，武后命人將二人手腳砍掉，浸入酒缸，直至她們死去。
據《資治通鑑》記載，王皇后死前向皇帝的方向拜了兩拜，祝皇帝長命百歲、萬壽無疆，並且非常平靜地說:“昭儀承恩，死自吾分。”意思是，現在武昭儀正承恩澤，所以死是我分內的事情。這句話看起來很普通，但她身為貴族女子的驕傲在其中表現得淋漓盡致。她說這話就意味著，她至死也不承認武媚娘是皇后，認為她沒有資格當皇后，永遠只是一個昭儀而已。 而蕭淑妃臨死之時則大罵武媚娘，說自己憎恨妖婦武媚娘，希望來世將變成一隻貓， 讓武媚娘變成一隻鼠， 自己就可以咬斷武媚孃的喉嚨，讓她痛苦地死去。
從此以後，武后禁止在宮中養貓，而且常常夜夢王、蕭二人披頭散髮，在宮中作祟。所以，她在執掌朝政以後，就常住東都洛陽，終生不歸長安。而且給王皇后改姓蟒，說她是蛇，心如蛇蠍;給蕭淑妃改姓梟，是一種惡鳥。 武后通過這樣的手段來侮辱二人，以平復自己的心理。
等除去這兩人，武后開始向朝中大臣動手。之前對於廢后一事，長孫無忌萬分阻撓，武則天的第一個目標就是除去長孫無忌這顆眼中釘。
顯慶四年(公元659年)，武后等到了這個機會。韋季方跟李巢捲入了謀反案，此案武后派她的心腹大臣許敬宗去審理，力求將長孫無忌也給捲進來。韋季方不想做出傷天害理之事，面對嚴刑便欲了結自己，以免遭受更多折磨。許敬宗抓住機會，又編排了不少關於長孫無忌的供詞，作為韋季方的供述向高宗轉達。高宗原本並不相信長孫無忌有謀反之意，但許敬宗一再強調此事的嚴重性，再加上武后也適時向高宗力陳其危，唐高宗原本主見就不強，聽了他們的話便法決定削去長孫無忌的官位，將其流放到黔州。不久之後，武后又派人前往黔州，逼長孫無忌自自縊而死。至此，長孫無忌與武后的鬥爭終於以武后的勝利而告終。
武后不但心腸狠毒，而且手段也非常高明，為的就是登上後位以及排除異已，讓自己獲得更多的權力。武后在朝廷裡廣植黨羽，培植自己的勢力。最初的願望只是做皇后，等真正成為皇后之後，接觸到了更大的權力，這才明白，自己原來還可以要求更多!於是，新一輪的戰爭又要打響了!
