藍藻是養殖水體中常見的有害藻類之一，喜歡高磷低氮的生長環境。如果清塘工作沒有做好，底泥中就會殘留一定數量的藍藻藻種，一般天氣反覆變化時，容易在水體中爆發性生長。藍藻釋放的藻毒素會造成河蟹的中毒反應，同時會消耗水體中的溶氧，對養殖對象造成極大危害！
1、藍藻藻種一般來源於清塘不徹底的底泥以及打進塘口的外源水，放苗前要做好清塘工作，使用漂白粉40-80斤/畝，生石灰200-300斤/畝進行徹底清塘。在向蟹塘中注入外源水時一定要選擇乾淨無汙染的水源，注水之後要做好解毒消毒。
清塘完畢放苗前，池塘會有很多有毒物質，像農藥殘留，清塘藥品殘留，底汙等，不處理乾淨就會導致蟹苗不適應，甚至死亡。因此放苗前一定要解毒，怎樣選擇合適的消毒產品呢？
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2、藍藻藻種在底泥中會處於休眠狀態，在環境達到其適宜的生長條件時會爆發性滋生，故清理乾淨底泥中的藍藻藻種很關鍵，可以使用強氧化性底改藥物，直接接觸底泥中的藍藻藻種並將其氧化，滅除藍藻藻種的活性，從而達到抑制藍藻的目的，同時還具有底部增氧的作用，緩解藍藻爆發導致的水體底部缺氧現象。
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3、藍藻爆發說明水體富營養化，蟹塘中存在大量不能被有效利用的營養，多使用複合芽孢菌提前把多餘營養消化掉，培養水體中有益菌群，和藍藻競爭水體營養，達到抑制藍藻繁殖的作用。
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