初始經驗治療：常見病原菌有草綠色鏈球菌、腸球菌屬、葡萄球菌屬、念珠菌屬、需氧革蘭陰性桿菌等感染。
首選藥物：首選苯唑西林，靜脈滴注，一次1~2g每4小時一次，加慶大黴素，靜脈滴注，一次80mg，每八小時一次。或首選青黴素靜脈滴注，一次400萬U，每六小時一次。或阿莫西林克拉維酸，靜脈滴注，一次1.2g，每八小時一次。或氨苄西林，一次2~3g，每6小時一次。加阿米卡星，靜脈滴注，一次0.4g，一日一次。療程一般4~6周
次選藥物：若有心臟修補術或者青黴素過敏，或者懷疑為耐甲氧西林的金黃色葡萄球菌感染時，可用萬古黴素，靜脈滴注，15mg/Kg，每十二小時一次，加利福平，一次0.3g，口服，一日2~3次
說明：對於人工心臟瓣膜心內膜炎和真菌性心內膜炎，療程需要6~8周或更長以降低複發率。應用慶大黴素和萬古黴素時需監測血藥濃度和藥物對耳、腎的毒性。
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