90年代初，上海大众并不满足于桑塔纳国产化的成功，开始尝试走联合开发的道路。1992年，上海大众和德国大众联合开发桑塔纳2000的工程正式启动。所谓联合研发，就是在巴西版的Quantum原型车基础上，重新设计了底盘轴距，比普通桑塔纳增长了108mm，同时还加大车身离地间隙和加大了后座的空间而得来。
桑塔纳2000从开发到上市只花了三年时间，1995年成功下线。作为中国人参与开发的第一个车型，桑塔纳2000最大的创意就是将车身自B柱以后拉长了10厘米，大大提高了后排乘员的乘坐舒适性，得到了用户的好评。同时1995年，上海大众累计生产桑塔纳轿车50万辆。
外观尺寸上，当时桑塔纳2000的长宽高分别达到了4680mm×1700mm×1423mm，轴距为2656mm，动力上依然采用的是1.8L四缸发动机，最大功率95马力（70千瓦），最大扭矩155牛米，采用5速手动变速箱，空车质量为1210公斤，百公里平均油耗仅为6.2L。
配置方面，当时的桑塔纳2000配备了真皮座椅、车内中控锁、电动车窗等，在当时这些算是豪华配置，相比普通桑塔纳有了很大的提升。在整个90年代，桑塔纳2000作为一款高品质商务轿车，迅速占领了国内中级公务及商务车市场。
事实证明，桑塔纳2000在当时是一个不错的选择，很好地起到了承上启下的作用。桑塔纳2000既与桑塔纳共用一个平台，降低了生产成本，又不同于桑塔纳低档公务车的定位。1995年推出市场后久销不衰，到2004年停产时，已保持了多年产销近10万辆的水平。
1995年桑塔纳2000推出之后的8年中，上海大众不断推陈出新，先后推出了“时代超人”、“自由沸点”、“俊杰”、“时代骄子”、“时代阳光”等系列改进车型。
1998年3月25日，推出了装备有AYJ电喷发动机的Santana 2000时代超人。整车排放达到欧Ⅱ标准。发动机配备了8气门电控多点喷射系统，最大功率由桑塔纳2000的95马力提升到了101马力，最大扭矩依然为155牛米。在安全方面，它配备了更多的安全装备，包括ABS、液压助力转向等，提供了更周到细致的安全保护。
2000年正值世纪之交，Santana 2000自由沸点于8月21日上市。在秉承了Santana 2000时代超人宽敞、舒适及动力强劲等特点的基础上，对保险杠、防擦条、控制面板的开关、内饰面料等方面做了更新设计。整体的黑色内饰隐约透着一丝活跃的红，整部车洋溢出朝阳般的动感和青春活力。
2000年11月1日，上海大众在桑塔纳2000时代超人的基础上，历时两年进行了多项技术和装备的改进，推出第一款装备自动变速器的桑塔纳2000 AT车型-“俊杰”。它也配备了AYJ型电喷汽油发动机，装置了4速自动变速器，分别在中国和德国道路进行了各种性能匹配试验和道路试验，均达到了大众汽车严格的质量标准。还增加了间歇式雨刮器、中央门锁、4喇叭音响系统、紫外线隔热玻璃等装备。
同原有车型比较，在2002年6月5日推出的桑塔纳2000时代骄子，在舒适性、安全性、产品外观的时尚性以及产品的质量四个方面又有了进一步的突破。它应用了中高级汽车才装备的发动机液压支承。内饰面料则采用新的针织方法，手感质感更佳。空调旋转面板由原来的拨杆式改为旋转式操纵结构。车内改进的遮阳板、新造型的三辐条方向盘以及全新的换挡杆，造型时尚、富有现代感。
2003年5月8日又推出了桑塔纳2000时代阳光，不仅装配了天窗，还增加了不少新的配置，包括安全气囊、车内防炫目后视镜、后玻璃防雾装置、防炫目外后视镜、中央后座两点式安全带、头枕高度可调等，当时这款车型是桑塔纳2000一系列车型中配置最高的，售价为18.7万元。
桑塔纳推陈出新的速度已经让我们眼花缭乱。虽然在现在看来，就和那些每年换个灯、换个轮毂的小改款车型一样没有新意，但是在当年这种方式却屡试不爽。截止2003年，桑塔纳在中国的保有量已经超过了200万台，对于当时的人们这种营销方式确实有足有的诱惑力，这也证明了上海大众不断追求创新的意识，当然至此桑塔纳更新的脚部依然没有停止，接下来上演的就将是桑塔纳3000的一阵“狂轰滥炸”。
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