在京城被李自成的农民起义军攻破后。一直不肯相信这最后结局终于到来的崇祯皇帝已经是丧魂失魄，哭笑无常，于是他拎着一把利剑去后宫“拯救”他的家人。
为了防止家人受辱，他首先是命周皇后自尽，宫待人出来汇报说：“皇后已经领旨！”之后，崇祯皇帝又命袁贵妃自尽。袁贵妃也在梁上自挂，不过绳子承受不住，断了。崇祯皇帝朝着袁贵妃连刺几剑，袁贵妃本能地躲闪，被刺中左肩。其余后妃也被崇祯传下了他最后一道旨意，让她们全数自裁。当天夜里，天启帝张皇后自缢。其余妃嫔也多数自尽，有几个不肯自尽的也被近侍杀死。崇祯又拎着剑去找他的女儿们。昭仁公主只六七岁，看到父皇进来，还没喊出声，便被崇祯一剑刺死。长平公主是十五六岁的少女，想像弟弟们那样逃出皇宫，她不愿就这样死去，但是崇祯皇帝不愿意，最后狠心朝长平公主猛挥一剑，公主用手一挡，这一剑砍断了长平公主的左臂，长平公主尖叫着倒在血泊里，昏了过去，之后由于种种原因被清军俘获，为笼络人心，清军将她嫁给了崇祯为她选定的驸马周显。
京城被破后，崇祯的三个儿子一路乞讨往南京陪都跑。崇祯皇帝长子朱慈烺，投奔到了自己的外祖父门下，但是他的舅舅和外祖父觉得这是一个烫手的山芋，于是希望朱慈烺离开，因此就吵起来，最后竟然打了起来，惊动了清政府，朱慈烺被抓，清军抓到朱慈烺后也觉得这是一个烫手的山芋，于是变说他是冒充的皇子，最后把他杀了。
皇三子朱慈灿出家做了和尚，后来被清政府擒获，最后的结局和朱慈烺一样，被清军以冒充皇子的罪名杀了。
最小的皇四子朱慈焕是运气最好的一个，在流亡途中他乞讨到了一户王姓乡绅家。乡绅知道朱慈焕的身份后，拉着他的手哭泣说：没有想到皇子会沦落到如此地步。乡绅收留了朱慈焕，给他改名字为王士元，之后又遇到了一位姓胡的官员，将自己的女儿许配给他，于是朱慈灿以王士元的身份一直活到了七十五岁，且生有三个儿子和两个女儿，又有了孙子，也总算儿孙满堂了。按道理说，朱慈焕这样一辈子也就知足了！但是他却在给自己的儿子们起名字的时候按照了明王室的辈分，取了“和”字，并且在最后的那个字上加上了“土”偏旁，这引起人们的注意。
即使朱慈焕改名字但还是被有心之人利用，竟然有人造反就用了这位七十五岁老人的名号，可惜最后被镇压，于是朱慈灿隐瞒多年的身份暴露了，虽然朱慈焕已经不停的换地方，最终还是被清政府抓住，且全家都被杀害了。
至此，崇祯皇帝的子孙全部被消灭，而且全部都是以“不是他的子孙”的名义被消灭的!
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