增值稅時代，杜絕了營業稅時期氾濫的發票代開情況，但依然為特殊情形下的發票代開預留了空間，總計起來有以下幾種情況：
1、小規模納稅人代開增值稅專用發票
小規模納稅人需要向客戶提供增值稅專用發票，只能到公司所在地國稅代開3%增值稅專用發票。這裡的小規模納稅人既包括有限公司，也包括合夥企業、個人獨資企業和個體工商戶中的小規模納稅人。
但截至目前，已經有五個行業的小規模納稅人可以自行開具增值稅專用發票了，這五個行業為：住宿業、鑑證諮詢業、建築業、工業以及信息傳輸、軟件和信息技術服務業。
另外需要注意的是，月銷售額未超過3萬元（或季銷售額未超過9萬元）的小規模納稅人如果享受免稅政策，不可以代開增值稅專用發票，如果需要代開或自開專用發票，則不能夠享受免稅政策。
2、其他個人代開增值稅發票
其他個人是有別於個體工商戶的自然人，由於不經常從事經營業務，不需要到工商稅務進行登記註冊工作，偶然從事經營活動，自然人應按照簡易計稅方法繳納增值稅，如需提供發票，應到稅務機關代開增值稅發票，實務中常見的又分為幾種情況：
（1）轉讓、出租二手房，自然人按照5%簡易徵收繳納增值稅，應到房產所在地地稅機關代開5%增值稅發票，如客戶為企業的，可以代開增值稅專用專票。
（2）建築工隊承包企業建築勞務工程，應以個人名義到勞務發生地國稅代開增值稅發票，按照簡易計稅3%徵收率；不能代開增值稅專用發票。
（3）自然人為企業提供諮詢、信息、中介、顧問等服務，應以個人名義到國稅機關代開增值稅普通發票，按照簡易計稅3%徵收率，不能開專票。
（4）個人向企業借款收取利息，應以個人名義到國稅機關代開增值稅普通發票，按照簡易計稅3%徵收率，不能開專票。需要注意的是，企業取得發票可以入賬，但稅前扣除需要關注兩個限制：
第一是借款利率不得高於金融機構同期同類借款利率；
第二是如果個人和借款企業時關聯方，利息扣除受到債資比的限制，超過實收資本兩倍的關聯方借款利息不得在企業稅前扣除。
自然人代開發票還有一個問題需要關注，就是個人所得稅的繳納。按照稅法規定，企業向個人支付款項，應代扣代繳個人所得稅。實務中如果個人主動到稅務機關代開增值稅發票，也可直接向地稅機關繳納個人所得稅，或者由開票的國稅機關代收個人所得稅。
問題的關鍵在於個稅如何徵稅？
我國的個稅不是綜合稅制，是分類稅制，實務中稅務機關將根據個人收入類別的不同計算繳納個人所得稅，如房租個稅繳納就有明確規定，以房租收入減除20%費用，再減除修繕費用（每次不高於800元），餘額為個人所得按照20%計算繳納個人所得稅。但大多數情況下個人所得的計算無明確規定，較為含糊，在這種情況下各地稅務機關通常對於無法準確計算個人所得的項目採取核定徵收方法，核定稅率從最低通常為1%，具體情況應根據各地稅務機關政策及判斷為準。
關於其他個人代開發票的情況，仍有一點需要注意，依據最新的《企業所得稅稅前扣除憑證管理辦法》規定，每天（次）發生增值稅應稅行為只要未超過起徵點，即300——500元的，可以不到稅務機關開具發票，下游企業憑藉收據和支付憑據等亦可在所得稅前扣除 。
3、非企業組織或單位發生增值稅應稅行為無法自開發票的，應到稅務機關代開。
通常也是按照不經常從事增值稅經營行為處理，按照簡易計稅方法的徵收率繳納增值稅。
依據最新的《企業所得稅稅前扣除憑證管理辦法》規定，政府機關和相關部門可以不開具發票，下游企業憑藉收據和支付憑證等亦可在所得稅前扣除。
除以上三類情況外，其他所有情況均必須由納稅人根據稅法規定自行開具增值稅發票，沒有取得發票則不僅不能增值稅進項抵扣，而且也無法在企業所得稅前扣除。
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