完全想不到!這種高致死率的酵母用來生產啤酒、麵包

完全想不到!这种高致死率的酵母用来生产啤酒、面包

來源:環球科學ScientificAmerican

酵母菌在人類生產生活可以說是必不可少,從食品到生物原料生產都充斥著這種微生物的身影。但是同樣,酵母菌在一些情況下,也會讓人類患上疾病。其中Candida krusei 就是五大致病酵母之一。在美國,每年有46000例酵母感染病例,且致死率達30%。但如果現在告訴你平時用來釀酒,做麵包的酵母菌隱姓埋名,而真身卻是致病菌,你會感到害怕嗎?

在美國,每年有4.6萬人感染一類致病性酵母菌——假絲酵母(Candida,又稱念珠菌)。由於對抗生素具有抗性,一旦感染,患者的死亡率高達30%。而包括克魯斯假絲酵母(Candida krusei)在內的五種最常見致病菌種,佔酵母感染性疾病的98%。C.krusei 引發感染的幾率雖不算高,但對免疫力低下的人群格外危險:根據一項對2002~2015年間病例的統計研究,C.krusei 引發的念珠菌血症,能將部分患者的死亡率提升20%以上。

與此同時,眾多對人體無害的真菌也在食品工業中被廣泛應用。庫德里阿茲氏畢赤酵母(

Pichia kudriavzevii)就是其中一種。這類酵母菌在自然界中廣泛分佈,美國食藥管理局將其定義為安全。在數個世紀中,該酵母被運用到了多種食物的加工中,包括非洲的木薯以及可可發酵、中國西藏和蘇丹地區的牛奶發酵、中國的麵包發酵和小麥發酵生產醋,以及一些泡菜、精釀啤酒的生產過程中。此外,P。 kudriavzevii 在生物科技裡的應用也日趨漸多,包括生產琥珀酸等重要化學原料。

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顯微鏡下的Candida krusei 菌株

這兩種看似不相關的酵母間,有著怎樣的聯繫?早在1980年,就有分類學家懷疑兩者是同一種酵母:研究者對C.krusei P。 kudriavzevii 進行了比對研究。通過脫氧核糖核酸聯繫分析、增殖測試等手段,他們認為前者就是後者的不完整版本。但由於缺乏更多證據,當時絕大多數科學家都未曾懷疑,食品生產中的常客P。 kudriavzevii,竟然就是致病性的C.krusei

基因序列揭示驚人聯繫

以往對幾種假絲酵母和畢赤酵母的研究,已經獨立展示了它們各自的基因序列。但迄今為止,針對C.krusei P.kudriavzevii 還完全沒有詳盡的基因分析比對。其中的關鍵原因是,對於兩者的研究完全是分裂的:醫學界的研究者通過臨床樣本研究C.krusei,而食品和生物技術領域的科學家則是從環境來源中提取並研究

P.kudriavzevii。不同的研究領域、不同的菌株來源,使得兩者間幾乎沒有交流。

針對這些問題,來自都柏林大學學院的Kenneth H。 Wolfe教授選取了一共32株酵母菌進行了基因組的測序分析,其中20株來自臨床分離的C.krusei,12株來自環境分離的P。 kudriavzevii 。研究中通過對兩種酵母菌的基因組DNA分別進行了測序,並且對內含子區域和核糖體蛋白編碼基因進行了對比分析。結果顯示,二者的基因組呈現高度的線性關係,也就是基因信息高度吻合:基因組DNA序列有99.6%是相同的。因此,這兩者實則是同一種酵母菌。

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內含子和核糖體基因組在兩種酵母菌顯示高度吻合

此外,系統生物學分析也證實,C.krusei P.kudriavzevii在演化樹上也屬於同一分支。

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演化樹上兩種酵母菌其實屬於同一分支

氟康唑(Fluconazole) 是一種抗黴菌類抗生素,通常用於真菌所造成的感染。此前人們已經發現,臨床分離的Candida krusei 對該抗生素具有極高的抵抗力。而現在,研究人員在

P。 kudriavzevii 身上同樣看到抗性:敏感性菌株在藥物濃度為1mg/L的情況下就會死亡,而P。 kudriavzevii 在8mg/L的藥物濃度下,依然活得非常旺盛。更加危險的是,對於治療假絲酵母的抗生素藥物氟胞嘧啶(Flucytosine),P。 kudriavzevii 顯現出更強的藥物抗性。

被測試的還包括兩性黴素、米卡芬等多種臨床上常用來針對真菌感染治療的藥物,實驗結果也很明顯,除了極個別臨床分離的菌株出現了藥物敏感,絕大部分菌株對於這些藥物都沒有明顯的反應。也就是說,這兩種酵母菌對於抗生素的抵抗力幾乎一樣高。這篇論文發表於近期的PLOS pathogens期刊。

工業化道路的取捨

臨床分離的菌株通常與環境分離菌株高度相似,研究團隊認為,其主要原因是環境中的菌群通過某些方式造成人類感染。這提醒我們,P.kudriavzevii 在生物工業中的應用,給生產工人甚至消費者都帶來了潛在的患病風險。

“如果我說我要用這個抗藥性致病菌來做食物,人們會立馬進行抵制,”文章通訊作者Wolfe教授表示,“但是當人們在食品工業改頭換面用了個新名字時,似乎就沒人在意這件事了”。

這提醒我們,在食品業和生物製造業中,酵母菌的使用必須足夠謹慎。“我認為在 Pichia 屬中選取其他種的酵母菌作為工業應用菌更好,”文章第一作者Alexander P。 Douglass表示,“相關部門應該採取更嚴厲的措施,來限制這種抗藥性酵母菌株在工業中應用,尤其是食品工業。”

P.kudriavzevii 在工業應用這麼久,為什麼卻沒有致病報道?Wolfe在接受《環球科學》記者採訪時表示:“在過去,共有五種假絲酵母被列為最高風險致病菌,其中就有Candida krusei ,但現在我們可以說P.kudriavzevii 也是其中一種。大多數報道感染病例時,使用的都是Candida krusei 這個名稱,但實際上也就是同名的P.kudriavzevii 。”

公眾是否有必要對這一問題感到擔憂?Wolfe也給出了自己的觀點:“這種酵母菌感染通常發生在免疫力低下或缺陷的人群中,比如器官移植人群或者艾滋患者。有著非常健康免疫系統的人群不必過於擔心此種疾病。”

由於我們可以在一些精釀啤酒,酸麵包或者泡菜中發現 P。 kudriavzevii 的蹤跡,Wolfe教授建議免疫系統低下的人群要避免食用這些食品。這種酵母菌感染,給免疫低下人群治療帶來了另外的挑戰,因為它幾乎完全無視常見的真菌抗生素。

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