嚴格來說《漢書》中就有倭國人時時朝貢的記載。《後漢書·東夷列傳》亦有“建武中元二年（公元57年）倭奴國奉貢朝賀，使人自稱大夫，光武賜以印綬。”的記載。1784年，光武帝御賜金印在日本北九州地區博多灣志賀島出土，刻有“漢倭奴國王”五個字。金印為純金鑄成，印體方形，長寬各2．3釐米，高二釐米，蛇紐，陰刻篆體字。漢安帝永初元年（107年），“倭國王帥升等獻生口百六十人，願請見。”這裡的“生口”指的是奴隸。但直到三國魏明帝時期，兩國多次互遣使臣，才詳細記錄下了當時倭國的情況以及女王——卑彌呼。
《三國志 魏書 東夷傳》記載邪馬臺先國主死後，國中大亂，互相攻伐數年，然後卑彌呼能行鬼神之事被立為王。景初二年派遣使者難升米和都市牛利前往魏國朝貢，獻男生口四人、女生口六人、班布二匹二丈。與此同時魏帝下詔慰勞她，並賞賜絳地交龍錦五匹、絳地縐粟罽十張、茜絳五十匹、紺青五十匹、紺地句文錦三匹、細班華罽五張、白絹五十匹、金八兩、五尺刀二口、銅鏡百枚[1]、真珠、鉛丹各五十斤。八年後，由於其與狗奴國男王卑彌弓呼不和，有遣使至魏求調解，魏國也派遣使臣至倭國宣讀詔書。
可以看到在三國時期倭國與中原的交流相對較頻繁，留下的記載較多，而且包括了當時日本的一些風土人情。比如，同樣來自《三國志 魏書》：“下戶與大人相逢道路，逡巡入草。傳辭說事，或蹲或跪，兩手據地，為之恭敬。對應聲曰噫，比如然諾。”即是說，身份低微的人在路上見到長官（大人，現在日本仍有此種稱呼），就進入草叢中談話（野戰起源？），或者蹲著或者跪著，兩隻手放在地面上，表現出恭敬地樣子（如今之土下座）。回話時說“噫”（考慮到語音變化，很可能就是現在通行的“嗨”），就像漢朝人說“諾”一樣。
其時中原王朝對倭國的記載都見於漢書、三國志和後漢書等較為可信的史料，參考價值與日本的神話傳說相比自不可同日而語。
日本還有卑彌呼即是天照大神的假說，因為在卑彌呼死亡前後247年3月24日和248年9月5日北九州地區出現兩次日食，有關學者認為這與天照大神躲入天之巖戶中使世界無光的記載吻合。此外，卑彌呼音同“火美子”，也與天照大神作為太陽神的身份相符。
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