6月7日，2018自然指數年度榜單（Nature Index 2018 Annual Tables）正式發佈，中國科學院位列該榜單全球十大科研機構首位。此前，中科院已連續6年位列自然指數全球首位。
全球十大科研機構排名2至10位的分別是美國哈佛大學、德國馬普學會、法國國家科研中心、美國斯坦福大學、美國麻省理工學院、德國亥姆霍茲國家研究中心聯合會、日本東京大學、美國加州大學伯克利分校、英國劍橋大學。
自然指數年度榜單展現了最近3年各個國家、機構和公司在指數入選期刊上的年度科研產出及排名情況。根據此次的榜單，美國仍是世界上高質量科研論文的最大貢獻國，中國和德國位居其後。儘管美國的科研產出較上一年略有下降，但依然保持領先地位。美國高質量科研產出仍是中國的兩倍多，而中國也延續著急速上升之勢。除美國外，中國、德國、南非、巴西都是所在區域的領先者。其中，中國是自然指數十大貢獻國中唯一實現指數值正增長的國家。
自然指數創始人David Swinbanks表示，中國持續和顯著地提升了指數中的地位，中科院繼續居於指數榜首，北京大學、清華大學、南京大學、中國科學技術大學 這4所中國大學已位居全球大學研究機構25強之列。
與前一年相比，中國有49家科研機構提升了在全球500強科研機構榜單中的排名，另有14家中國機構新進入了全球500強，僅有15家位次下滑。相比之下，美國有62家機構排名上升，74家下滑。位居自然指數整體排名第五位的日本只有4家機構排名上升，15家下滑。
“鑑於納入指數的期刊每年發表的論文數量近乎不變，中國論文數量的增加不可避免地讓其他國家失去其論文份額，特別是美國、德國、英國、日本、法國、西班牙和澳大利亞。但美國依然是卓越的科研國家，在全球科研機構100強中佔有46席。”Swinbanks補充說。
該榜單還列出了自然指數全球十大企業科研機構，分別是瑞士霍夫曼·羅氏公司、美國IBM公司、瑞士諾華公司、美國默克公司、英國阿斯利康公司、美國輝瑞公司、英國葛蘭素史克公司、新西蘭GNS Science、韓國三星集團、美國安進公司。
自然指數由施普林格·自然（Springer Nature）旗下自然科研（Nature Research）編制，於2014年11月首次發佈，通過追蹤高質量自然科學期刊所發表的科研論文的作者信息，為科研共同體提供有關全球科研狀況和出版趨勢的信息。自2018年6月起，納入自然指數的期刊數量已由原先的68本增至82本。自然指數目前採用兩種計算論文產出的方法，其中論文計數 (AC) 指不論一篇文章有一個還是多個作者，每位作者所在的國家或機構都獲得1個AC分值；分數式計量（FC）則考慮了每位論文作者的相對貢獻。
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