首先，封建權力的一個基本邏輯：統治者只有一個，代入這個邏輯，分析古時候那些君主權臣做的事情，就知道了。做這些事情既是為了驗證也是表示自己是那個人，那個掌握大權的人。萬曆搞張居正，既能出自己這麼多年受的窩囊氣，還能肅清前任影響（主要是這個），一舉多得，為什麼不搞呢?縱觀史書，皇帝前任要是自己的爹或者媽的，都是供起來的。他們的臉就是自己的臉，他們的影響就是兒子的影響，他們說的話做的事自己都是要支持的。
前任是那些什麼託孤大臣，什麼攝政王的，有一個算一個通通要搞死，國家是寡人的家，不是他們的，他們之前做的事說的話朕滿意才可以，不滿意祖墳都給你刨了。另外，呂后和武則天都是一樣掌權，為什麼史書評價不一樣？因為呂后的兒子死絕了，之後繼承的和姓呂的一點關係沒有。武則天被退位之後還能安享晚年，是因為接她班的是她親兒子，肉爛在鍋裡，往後唐朝皇帝永遠有她武則天的血脈，那些小輩再怎麼作，不能打自己祖宗的臉吧。
張居正沒能把成為萬曆的自家人，也沒有成為家的主人，只是短暫的來借個宿，家裡孤兒寡母的，他就順便把屋收拾得井井有條把大梁挑起來了，等小孩子長大了當家了，一想到這麼多年有個人在家裡對自己指手畫腳的，他的結局就已經註定。而張居正要成為這個自家人，不止是萬曆心裡的自家人，還要讓群臣百姓都要相信他們是一家（諸葛亮做到了）才可以，這兩個都好難。成為家的主人，這個選項在明朝不要考慮，前中期造反可能成功的前提，首先你得姓朱。後期當這個家，還有那個事業心的話，能累死我覺得一開始的時候張居正老師的個人汙點在萬曆看來都能原諒。
畢竟對自己對國家恩情太大了，而且萬曆並沒有認識到這個問題觸及皇權根本了。但是日子久了，身邊的不同黨派，之前大多被張居正打壓過，到了報復的時候了，死後清算，生前鬥不過你，你死了我想怎麼說就怎麼說了。老百姓在說，言官也在說，身邊的太監可能也在說，當他心裡根深蒂固的認為張居正大於皇權的時候，這個時候，張居正就危險了。皇權被挑戰，在他的太祖朱元璋、他爺爺嘉靖等任何一個皇帝心中絕對是不允許的，這是皇帝的尊嚴！萬曆就這樣慢慢的一步步的堅定了清算的念頭。皇權，是根本原因！在任何一個皇帝心裡，這是尊嚴！五、附加討論28年不上朝，遲遲不立太子。
張居正觸及皇權根本這件事對於他個人打擊實在有點大了，在清算張居正的時候，萬曆是一個不到25歲的少年，自己一生中最崇拜的人竟然是這樣，自己竟然把他墳給刨了，並且使用了明朝最為殘酷的刑法之一。在此之後，難免有些心灰意冷，再加上言官對萬曆本人指指點點，一有不對的便指指點點。在萬曆心中，我個人覺得應該都是在挑戰皇權，誰想命令萬曆？我是皇帝，我的尊嚴不容得你們說三道四，立誰為太子這是我的家事，或者是我皇帝自己的事情，你們要是誰敢提這個事，就是在挑戰皇權？就有種一朝被蛇咬十年怕井繩的感覺！個人認為張居正算是明朝能拿的出的最優秀的政治家，沒有之一，儘管有些劣跡。
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