新帝朱常洛登基几日，连续颁布了几条新政，主要针对万历时的弊端，想要打开一个全新的局面，同时也是为自己三十九年正名。可是只过了短短的四天，就有了不豫之兆。登基十天后，八月初十，原本就身体不济的朱常洛病倒了。他病倒的原因一是由于身体本身就衰弱，再加上刚刚登基，朝中有许多事情需要交接，以及先皇的丧事处理等，过度劳累使他身体日渐虚弱。二是加上朱常洛好色的毛病。朱常洛登基后，郑皇贵妃出于自己的谋划，向朱常洛献上了八名女子，这八名女子不仅美丽非凡，并且非常具有才华，最主要的是非常温柔体贴，让受尽冷眼的朱常洛感受到了少有的温暖。
郑皇贵妃的阴谋
这一日，郑皇贵妃来到乾清宫，身后跟着的是一个宦官，名叫崔文升。崔文升以前是郑皇贵妃的内官，在光宗继位后，提升为司礼监秉笔。秉笔就是代替皇帝书写的内官，他还掌管着御药房。
御药房，他直接负责皇帝的医疗与保健，在明朝初年的时候为尚药局，后改为御药房。明朝又是一个宦官当权的朝代，宦官当权为当家人，而非是御医，院使，院判，皇帝以及后妃的药的取用、熬制以及送药都是御药房。有一个太监名叫张明，他被记入史册的原因并非具有高超的医术，而是因为牵扯着一桩后宫案。《酌中志》中记载，神庙贵妃李娘娘有疾，郑娘娘名下太监张明治未愈，薨逝。把张明比作汉宣宗时期毒杀许皇后的医妇淳于衍。影射出郑贵妃毒害李娘娘。
崔文升按照正常的看病程序，一番望闻问切之后，断出皇帝身体并无大碍，只需要喝几服药补补身体就可以。光宗听后，连夸崔文升是忠臣，并欣然接受。傍晚，一碗汤药送到了御前，朱常洛饮下汤药后当晚，腹泻数十次，不但没有把病治好，反而使早已亏空的身体丢掉了剩下的元气。
时任兵科给事中的杨涟，履行自己进谏的职责，暗指郑皇贵妃与崔文升暗中勾结，加害新帝。像这种与皇帝安危有关的案子，属于重大案件，一般交由三法司来就行处理，这是正常的司法程序，但是有时候，危害皇帝的安全让皇帝非常的生气，或者说让皇帝造成了非常重大的损伤，那么皇帝就很有可能把这些案件交给自己的亲信私发组织，比如说锦衣卫，东厂，西厂来处理。
可是，在杨涟的坚持下，朱常洛给出的最终判决是仅仅将崔文升逐出宫外，皇帝既然已经这样判决，那就是当时最高的判决，比最高的司法机关判决更有效，不知是有意为之，还是无心追究，只是夸奖了杨涟的忠心，却没有对他怀疑郑皇贵妃的事情有直接的反馈，对于这样的结果，杨涟作为臣子，只能就范，但是他心中已经有了判断。
逆耳忠言不敌枕边细语，光宗的宠妃李选侍，也是郑皇贵妃，安排到新帝身边的触角之一，李选侍的受宠程度，不亚于当年神宗对郑皇贵妃的宠爱。身体已经垮掉的朱常洛在乾清宫召见大臣的时候心心念念的竟然是封李选侍封为皇贵妃，对于这样的皇帝，他又能怎么样要求什么呢？
就在崔文升被逐出皇宫的几日后，病入膏肓的朱常洛终于想起了自己作为皇帝的责任，再次在病榻前，召集方从哲等大臣，此时，他讲到父亲还没修好的陵墓，十分悲切的说，“朕，寿宫也。”交代完身后事之后，突然问了一句，有鸿胪官进药者安在，众位大臣们顺时间非常懵，这鸿胪寺的人怎么会进药呢？皇帝又是怎么知道这种人存在的呢？
进献红丸
太医院，是管理整个皇室的医疗、医药，但是设立御药房之后，大部分的责任都转移到了御药房的身上，皇帝和后妃有病的话，太医院只负责诊断，开药方，配药送药煎药都是御药房的来管理。但是，鸿胪寺只是一个四品衙门，掌管朝会、宾客、吉凶仪礼之事。
在皇帝下召在全国内找名医治病之后，鸿胪寺丞李可灼曾上本说，他有“仙丹”红丸，可以治疗万岁的病，大臣与御医们都非常反对这件事，各地名医都无法治好皇帝的病，更何况是这粒来历不明的药丸，这可是天大的事，一旦出现什么问题，肯定是要有几位需要陪葬。作为内阁首辅的方从哲只能劝谏，但是总归拗不过皇帝的坚持，召见自云有仙丹的李可灼，李可灼觐见了朱常洛后，奉上了所谓的仙丹，朱常洛服用后，身体似有些好转，并大赞李可灼是忠臣，李可灼轻步走出了乾清宫，在乾清宫外等待的大臣们，簇拥上前询问情况，李可灼只说“平善如前”。
朱常洛驾崩
九月初一，天色微亮，紫禁城里，在短短一个以后，送走了刚刚登基的新皇帝，这与他数十年的太子位相比，这一个月短的让人叹息，郑皇贵妃再次来到乾清宫，看到了灵柩前痛哭的李选侍，貌似是看到了当时神宗皇帝驾崩时的自己。
寂静的慈宁宫内，郑皇贵妃放佛听到了一些关于新帝驾崩的一些传闻，她偷偷了解了李可灼的来历，对仙丹也了解大概。所谓的红丸，就是红铅金丹，又成三元丹，官吏称之为无方无制之药，民间称取处女初潮之经血，谓之先天红铅，加上夜半的第一滴露水及乌梅等药物，煮过七次，变成药浆，再加上红铅、秋石、人乳、辰砂、松脂等药物炮制而成，是药是毒，要看它服用的时间与剂量，根本没有明确的界限。
郑皇贵妃清楚，崔文升被逐，皇帝已逝，这件事情，早晚会同之前的梃击一案一样，化作时间中的尘埃，尘封于紫禁城内，所以一切没有任何直接的证据，除了她与崔文升当年的关系，何况这红丸，才是朱常洛送命的仙丹，李可灼恐怕是急功近利，却葬送前程的替死鬼，更重要的是，她早懂得，深宫之中也没有什么律法，只有权利才是唯一的律法。
红丸案追查
对红丸案的追查，众人齐齐指向开方的太监崔文升，和进药的鸿胪寺丞李可灼，最初给皇帝治病的崔文升成了众人口中的投毒之人，原来，崔文升给朱常洛开的是“大黄”药，大黄的主要功效在于清热泻火，有余者泻，不足者补。是正常的用药之理，可是面对已经被纵欲生活和繁忙朝政掏空了身体的光宗皇帝，崔文升竟然开出了这样一副药，虽然没有一剂剧毒之物，但也绝对不是什么良药，寻常人用此药无妨，但对于虚弱的光宗来说，这足以拿走他半条性命。
崔文升以误诊为自己开脱，然而这反而令人怀疑，因为他可不是一个普通的太监，曾经是郑皇贵妃内侍太监，崔文升几年后，就被晋升为掌御药房，懂得医药，何况崔文升面对的病人是一国之君朱常洛。这种误诊，岂是他能脱得了责任的，更重要的是崔文升开的药是催垮朱常洛身体的关键，也是后来红丸案光宗驾崩的根源，大臣们把这几味疑点报告给天启皇帝，急正崔文升典刑，用章国法。但是由于崔文升是宦官，因此免了他的基层审理，甚至免除了三司会审，而直接由皇帝发落，正好得益于皇权与司法之间的空隙。另一方面，面对朝中大臣，郑皇贵妃深深明白，以她与崔文升的过往，定罪崔文升，也等于是定罪了自己，此后大臣们一定会牵扯出别的案件来，将自己带进深渊，因此她不得不收敛羽翼，蜗居在寝宫之中，等待新帝的定夺。刚刚登基的朱由校天性懦弱，再加上没有直接的证据，他和他的父亲一样，放了崔文升，这样使郑氏松了一口气。
另一方面，朝中的大臣们也放不了送仙丹的李可灼，大家回忆起，光宗驾崩的前一天，内阁首辅方从哲代替稍有恢复的朱常洛，颁布一道谕旨，嘉奖进送仙丹的李可灼。也正是因为这一圣旨，也将红丸案的主谋指向了光宗皇帝本身。原因是，红丸是光宗皇帝要求的，并且身体也见有起色，并且嘉奖了李可灼。就因为这一圣旨，激怒了朝中的大臣们，将方从哲与李可灼放在了同一罪犯的一边。最终只能通过廷议来定责。最终廷议也没有讨论出比较好的结果，崔文升与李可灼都可以斩，该贬则贬，该罚责罚，就这样从政治斗争中发生了微妙的变化，成了明朝一大疑案。
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