锦衣卫，这个在中国历史上难以磨灭的国家机器，曾经一度成为大明的代名词。
历史上的锦衣卫曾经凶名赫赫，皇帝一人之下，掌管刑狱，专职巡察缉捕之事，队伍多达近十万人，上至王公大臣，下至贩夫走卒，无不可管之人，一时风光无两。然而这一切，在1644年戛然而止。
1644年（农历甲申年），李自成攻入北京、崇祯皇帝自缢于煤山、清军入住中原大地，曾经无限繁华的大明王朝轰然倒塌。作为大明最出名的机构——锦衣卫也像一夜之间人间蒸发了一样，就此退出历史舞台，消失得无影无踪。
崇祯在位之初，虽然曾经大力削减甚至撤销过锦衣卫、东、西厂这些特务机构，但为了巩固皇权需要，最终锦衣卫还是得以起复使用。到1644年，大明锦衣卫仍然拥有8万多成员。这些直接听命于皇帝的大明精英，随着皇权的崩塌，结局也十分悲惨。
一、保卫皇城死伤无数
虽然在我们日常看到的影视剧中，锦衣卫多以破案侦缉的形象出现，但是锦衣卫其实还有一项重要职能，那就是守卫值宿，也就是皇宫的保安和皇帝的保镖。
所以，在李自成进攻北京城的时候，大明的守卫军有相当一部分来自于锦衣卫。1644年3月19日凌晨，李自成从彰义门杀入北京城。得到消息的崇祯曾经从东华门、齐化门（朝阳门）、安定门三个方向逃离，但都没有成功。这意味着，守城的士兵基本上已经死伤殆尽，其中自然包括卫戍京城的锦衣卫。
此后，崇祯才在：“诸臣误朕也，国君死社稷，二百七十七年之天下，一旦弃之，皆为奸臣所误，以至于此。”的叹息中，自缢身亡。
二、接受收编回归本职
清军入关时，因为打的是帮助大明清剿反贼的旗号，所以在击败李自成后，清廷在政治制度上沿袭了明朝的体系，并接管了明朝在北京设置的官僚机构，锦衣卫自然也在其中。
但为了招揽民心，锦衣卫的职能在满清政权发生了巨大变化。在顺治元年，锦衣卫虽然名称没有改变，但是其刑狱、侦缉的权利全被撤销，而只作为皇帝的仪仗队存在。
说起来朱元璋最早设立锦衣卫，本就是以“拱卫司”为班底，也就是说，锦衣卫最初的职能就是皇帝的仪仗队。一番兜兜转转，又回到了原点，曾经风光无限的锦衣卫们，不知道作何感想。
到了顺治二年，出于锦衣卫在民间凶名赫赫的考虑，为了稳固江山的清廷干脆连锦衣卫的名字也去掉了，改成了銮仪卫。至此，横行两百多年的锦衣卫在中华大地上不但实际已经灭亡，连名字也不存在了。
“銮仪卫”这一称呼一直沿用到宣统时期，为了避讳宣统皇帝溥仪的名字，又改成銮舆卫，然后到溥仪退位，锦衣卫的前世今生彻底结束。
三、流亡海外壮烈殉国
伴随着大明的灭亡，锦衣卫除了这两个归宿以外，其实还有一部分离开了中国，流亡到了海外，他们就是与南明王朝一路相随的大明最后的锦衣卫。
清军入主中原以来，各地反清复明运动此起彼伏，其中又以明室后裔旗帜最为鲜明。1646年末，明神宗朱翊钧之孙、桂王朱由榔在广东肇庆称帝，以永历为年号，建立了南明永历朝。
然而，这个弱小的王朝还没站稳脚跟，就被南下的清军击溃，随后朱由榔一路辗转到贵州、广西、云南等地。
满清政权好不容易夺取江山，岂会容忍朱家死灰复燃。由吴三桂率领三路清军一路穷追不舍。中华大地已无立身之地的朱由榔迫不得已，仓皇出逃到缅甸境内，以待东山再起。
在大明时期，缅甸乃是明朝的藩属国。所以对于朱由榔一行的到来，缅甸国王一开始还是比较热情的。然而随着清廷的不断施压，加上缅甸本国出现政变，新上任的国王态度并不友好，朱由榔在缅甸的处境变得岌岌可危起来。
公元1661年8月12日，已存了心思要把朱由榔出卖给清廷的缅甸国王莽白，以喝咒水起誓结盟为由，派使臣约朱由榔到过江议事。
永历朝廷自然怀疑其中有诈，不肯前往。相持之下，大明最后一任锦衣卫指挥使、永历朝大学士、文安侯马吉翔、太监李国泰等提出要由黔国公沐天波一同前往，方能放心。
沐氏家族世代镇守云南，在当时西南边境及各接邻小国中甚有威名。永历朝天真地以为，有沐家人在，缅甸当局不敢轻举妄动，然而他们却小看了缅甸的心狠手辣。
在沐天波的陪同下，马吉翔等一干永历朝文武大臣出发前往约定地点。刚一到，他们便被三千缅军团团围住。缅方指挥官派士兵想把沐天波拉开，但是忠心耿耿的沐天波一看势头不对，立刻夺了士兵的刀奋起反抗，其余人也就近抓取木棒等武器一同突围。
然而终究是实力悬殊，包括沐天波、马吉翔在内的所有人员全部战死。随后缅军攻入朱由榔行宫，大肆烧杀抢掠，朱由榔被缅军转交给了清廷。
此事在历史上被称为“咒水之难”，大明最后的锦衣卫与南明政权一起被埋葬在了异国他乡。
1662年4月14日，朱由榔在昆明被清军用弓弦勒死， 吴三桂因此役立功，进封为亲王。
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