2008年，有關部門的專家們耗時五年時間，通過研究光緒皇帝的頭髮絲，最終得到了光緒皇帝的死因：死因砒霜中毒。
光緒皇帝死於1908年11月14日，慈禧太后死於1908年11月15日，兩人死亡時間相差不到24小時。在人們的心目中，兩人死亡時間相隔如此之近，光緒之死是慈禧太后下的毒手。在沒有最新證據出現之前，這是目前被大家廣為接受的說法。
那麼，慈禧太后究竟為何臨死前一定要處死光緒，兩人究竟有什麼不共戴天之仇？慈禧太后和光緒之間的矛盾向來已久，歸根到底都是權力之爭。慈禧太后要繼續“垂簾聽政”，最先需要做的事就是牢牢掌控光緒；而希望能有一番作為的光緒要實現親政，則需要搬掉面前慈禧太后這座大山。
根據大清祖制，皇子在十五歲左右就一定要大婚，大婚後就意味著皇帝要親政。可慈禧太后一直遲遲不願給光緒皇帝舉辦大婚，直到光緒十五年（1889年），光緒19歲時才給他舉辦大婚。
不僅如此，慈禧太后還一手將侄女安排當了光緒的皇后，讓她從中監視光緒。應該說慈禧太后對光緒有養育之恩，同治死後，年僅4歲的光緒進宮，慈禧太后還是盡心盡力的照顧。可在權力面前，親情卻是極其地微不足道。
慈禧太后和光緒兩人矛盾的集中爆發，在“戊戌變法”之變後。變法失敗後，光緒被囚禁於南海瀛臺，徹底成為了傀儡皇帝。很快，慈禧太后以光緒皇帝名義發佈諭旨:
“朕躬自四月以來，屢有不適，調治日久，尚無大效。京外如有精通醫理之人，即著內外臣工切實保薦候旨，其現在外省者，即日馳送來京，毋稍延遲。”慈禧太后以光緒生病為幌子，準備廢黜光緒。
這件事引起了輿論譁然，慈禧希望藉助製造光緒病重的假象，讓他“徹底消失”。這一切都讓光緒對慈禧太后仇視，更過分的是，庚子之變慈禧太后在西逃時，竟然命人將光緒最喜愛的珍妃投井。
一系列重大事件後，光緒恨不得立即誅殺慈禧太后，只恨手中無權。反觀慈禧太后，她也深知自己一旦去世，光緒親自自己必將會死無葬身之地。與其這樣，不如先下手為強，正所謂“關懷之殷，情同骨肉；政見之爭，有如仇讎。”
參考資料：《清史稿》、《光緒朝東華錄》
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