三藩之亂（1673年—1681年），是清朝初期三個藩鎮王發起的反清事件。
1673年（康熙十二年），吳三桂為首的平西、靖南、平南三藩，以朝廷撤藩之議為由，結合海內外反清勢力起兵反叛。康熙先是通過分化三藩，招撫耿精忠、尚之信歸順清廷，孤立吳三桂致其積鬱而死。後清軍進入雲貴省城，吳三桂孫子吳世璠自殺，歷時8年的三藩之亂被平定。
清廷在平叛戰爭結束後，沒收藩產入官充當軍餉。同時，受“三藩”割據之害的人民得到解放，給這些地區的社會經濟的恢復和發展提供了必要的條件。
康熙親政後，敏銳地察覺到三藩已經成為國家的心腹大患，把它列為自己必須要解決的三件大事（三藩、漕運、河務）之一。雖然，康熙帝認識到三藩問題的嚴重性，但是當時財力和兵力有限，並不敢貿然行動。康熙十二年（1673年）3月，尚可喜主動請撤藩歸老遼東。康熙立即抓住機會，答應了尚可喜的請求，並對他的行為表示讚賞。康熙的行為引起了其他兩位藩王的警戒，於是他們也相繼請撤藩歸遼東以為試探。康熙以“撤亦反，不撤亦反”，果斷下令撤藩。11月，吳三桂發動叛亂，耿精忠、尚可喜的兒子尚之信及廣西將軍孫延齡先後響應，清政府軍事上並無準備，一時，三藩佔據了雲南、貴州、廣西、廣東、福建、湖南、四川等省，以及湖北、浙江、陝西、甘肅等部分地區。
1675年，吳三桂與清軍的對抗到了頂峰。吳三桂在湖南沿江佈置防禦工事，不敢再向北發展，康熙帝抓住機會調整戰略、安排兵力。他首先堅決打擊吳三桂，而對其他的叛變者卻實行招撫，通過分化反叛力量而孤立吳三桂。1678年，尚之信、耿精忠及陝甘的王輔臣相繼投降。同一年，吳三桂在衡州稱帝，國號周，年號昭武，開科取士。不久吳三桂病死，吳三桂的孫子吳世璠在貴陽即位，改年號洪化。1680年，吳世璠逃到雲南。次年，清軍攻入雲貴省城，吳世藩自殺，歷時八年的三藩之亂被平定。不久之後，朝廷在福州、廣州、荊州設八旗駐防，以加強對南方的控制。
平定三藩，對於清廷來說，是真正完成統一、確立穩定的皇朝統治的標誌。
清康熙初，平西王吳三桂鎮雲南，平南王尚可喜鎮廣東，靖南王耿精忠鎮福建，時稱“三藩”。“三藩”多擁重兵，久鎮其地，形同割據。康熙十二年（1673）3月尚可喜自動請撤藩歸老遼東，吳三桂、耿精忠亦相繼請撤藩歸遼東以為試探。康熙以“撤亦反，不撤亦反”，下令撤藩。吳三桂於11月發動煩亂，耿精忠、尚可喜子尚之信及廣西將軍孫延齡先後響應，清政府軍事上並無準備，一時，三藩佔有雲、貴、桂、粵、閩、湘、蜀等省，以及贛、浙、陝、甘、鄂的一部。清政府在政治上實行分化瓦解；在軍事上遏制吳部於湖南，然後剪其兩翼。十五年，尚之信、耿精忠及陝甘的王輔臣相繼反正，吳三桂于衡州稱帝，國號周，年號昭武，開科取士。尋吳三桂病死，孫世璠嗣位於貴陽，改年號洪化。十九年吳世璠敗走雲南。次年，清軍入昆明，吳世璠自殺，三藩亂平。耿精忠、尚之信等被處死，藩產入官，盡撤藩軍入北京。尋於福州、廣州、荊州設八旗駐防，以加強對南方的控制。
三藩各擁重兵，久據數省。平南、靖南二藩各有兵力十五佐領，綠營兵各六七千，丁口各兩萬；平西王所屬兵力五十三佐領，綠營兵一萬二千，丁口數萬。吳三桂功高兵強，四方精兵猛將多歸其部下。清廷又擢升其部將王輔臣為陝西提督，李本深為貴州提督，吳之茂為四川總兵，馬寶、王屏藩、王緒等十人為雲南總兵。三藩勢力幾及全國之半。
吳三桂初鎮雲貴，清廷曾准予便宜行事，雲、貴督撫全受他節制，所除授文武官員，號稱“西選”，“西選”之官幾遍各地。當時有“西選之官遍天下”之說。順治十七年，雲南省俸餉九百餘萬，加以粵閩二藩運餉，年需兩千餘萬。鄰近諸省挽輸不足，則補給於江南，致使清朝財賦半耗費於三藩。吳三桂自恃勢重，益驕縱，踞明桂王五華山舊宮為藩府，增崇侈麗，盡據明黔國公沐氏舊莊七百頃為藩莊，圈佔民田，迫令“照業主例納租”，並“勒平民為餘丁”，“不從則誣指為逃人”。又借疏河修城，廣徵關市，榷鹽井，開礦鼓鑄，壟斷其利，所鑄錢，時稱“西錢”。吳三桂專制雲南十餘年，“日練兵馬，利器械”，暗存硝磺等禁物。通使達賴喇嘛，互市茶馬，蒙古之馬由西藏入雲南每年數千匹。他遍佈私人於水陸要衝，各省提鎮多有心腹。部下將士多李自成、張獻忠餘部，勇健善鬥。其子吳應熊為額駙，朝政鉅細，可以旦夕密報。於是，吳三桂自以為根蒂日固不可拔，朝廷終究不會從他手中奪去雲貴。
耿精忠襲封王爵後，縱令屬下奪農商之業，“以稅斂暴於閩”，縱使其部下“苛派伕役，勒索銀米”。又廣集宵小之徒，因讖緯有“天子分身火耳”之謠，妄稱“火耳者，耿也。天下有故，據八閩以圖進取，可以得志”。
尚可喜在廣東令其部屬私充鹽商，又私市私稅。廣州為對外通商口岸，“每歲所獲銀兩不下數百萬”。尚可喜對清廷比較效忠，但年老多病，將兵事交其子之信。尚之信素性桀驁，橫暴日甚，招納奸宄，布為爪牙，罔利恣行，官民怨恨。又酗酒嗜殺，常在其父面前持刃相擬，所為所行，日益不法。至此，三藩各據一方，互通聲氣，廣佈黨羽，實際上已成為割據勢力。
康熙帝決定撤藩三藩勢成割據，嚴重威脅著清朝的統治和國家的統一。早在順治死時，吳三桂擁兵北上入祭，兵馬塞途，居民走避，清廷恐吳三桂生變，命其在城外張棚設奠，禮成即去。康熙帝親政數年，深知朝廷中外之利害和前代藩鎮之得失，曾說：“朕聽政以來，以三藩及河務、漕運為三大事，夙夜厪念，曾書而懸之宮中柱上。”康熙六年，吳三桂以目疾請解除總管雲貴兩省事務，以相試探。康熙帝命吳三桂將所管各項事務交出，責令雲貴兩省督撫管理。雲貴總督卞三元、提督張國柱、李本深合詞請命平西王仍總管滇黔事務。康熙帝以照顧吳三桂身體為理由，予以拒絕。
1673年（康熙十二年）三月，平南王尚可喜疏請歸老遼東，留其子尚之信繼續鎮守廣東。經戶、兵兩部和議政王貝勒大867 臣集議，認為如果尚之信擁兵留鎮廣東，跋扈難制，康熙帝遂詔令盡撤全藩。吳三桂和耿精忠得知不能自安，在同年七月先後疏請撤兵，以試探朝廷意旨。經戶、兵二部確議，吳三桂及所部五十三佐領官兵家口應俱遷移。疏下議政王大臣會議，大學士索額圖、圖海等多以為三藩不可遷移。惟有刑部尚書莫洛、戶部尚書米思翰、兵部尚書明珠等力請徙藩。康熙帝再命議政王貝勒大臣及九卿科道會同確議，畫一具奏。諸王以下所見不一，仍持兩議。康熙帝考慮到藩鎮久握重兵，勢成尾大，非國家之利；又以為吳三桂之子，耿精忠諸弟都宿衛京師，諒吳、耿二人不能發動變亂。遂下令三藩俱撤還山海關外。
吳三桂、耿精忠疏請移藩，實迫於形勢，並非本意。吳希冀朝廷慰留，如明代沐英世守雲南之先例。及撤藩命下，愕然失望，遂與其心腹聚謀，暗中部署兵馬，禁遏郵傳，只許入而不許出，並勾結他省舊部，又與耿精忠聯絡應和，準備叛亂。康熙十二年八月清廷命禮部侍郎哲爾肯等赴雲南，戶部尚書梁清標等赴廣東，吏部侍郎陳一炳等赴福建，各持敕諭，會同該藩及督撫商榷移藩事宜。九月，清廷命陝西總督鄂善總督雲南軍務，寧夏總兵官桑額提督雲南軍務。此時吳三桂與其黨正日夜加緊密謀。侍郎哲爾肯、學士傅達禮等既至雲南，催促起行。吳三桂表面拜詔，而屢遷行期，反謀益急，而難於舉兵之名。欲立明朝後裔以號召天下，但緬甸之役及殺害永曆帝無可自解；欲行至中原據腹心之地舉兵，又恐日久謀洩。是年十一月，吳三桂起，殺雲南巡撫朱國治，拘捕了按察使以下不順從的官員，發佈檄文，自稱“原鎮守山海關總兵官，今奉旨總統天下水陸大元帥，興明討虜大將軍”。佯稱擁立“先皇三太子”，興明討清，蓄髮，易衣冠，傳檄遠近，致書平南、靖南二藩及各地故舊將吏，並移會臺灣鄭經，邀約響應。雲南提督張國柱、貴州巡撫曹申吉、提督李本深等隨吳三桂反。雲貴總督甘文焜在貴州聞變，馳書告川湖總督蔡毓榮，急走至鎮遠，被副將江義以兵包圍，甘文焜自殺，三藩之亂由此開始。
自1673年（康熙十二年）十一月二十一吳三桂起兵叛亂。至1681年（康熙二十年）十月二十九吳世璠自殺，清軍進入昆明，三藩之亂歷時八年。其演變過程，大致可分為三個階段。
第一階段
1673年（康熙十二年）十一月至十五年四月。戰亂不斷擴大，吳三桂兵出三貴，進據湖南澧州、常德、嶽州、長沙；清軍雲集荊州、武昌、宜昌，但不敢渡江攖其鋒。孫延齡叛於廣西，羅森、鄭蛟麟、吳之茂叛於四川，耿精忠叛於福建，臺灣鄭經渡海進兵福建漳州、泉州和廣東潮州，提督王輔臣又叛於寧羌，擊殺清陝西經略莫洛。四方震動，人心動搖。康熙帝欲親征，經議政內大臣密議諫止。清軍東征西討，顧此失彼。隨後尚之信又叛於廣東，總督、巡撫俱附之，清廷增兵兩江。
第二階段
1676年（康熙十五年）五月至十七年七月。以王輔臣敗降平涼為轉機，形勢向有利於清軍發展。隨後，因鄭經部爭據福建漳、泉、興、汀等地，耿精忠腹背受敵，倉促撤兵請降。尚之信也相繼投降。孫延齡又被吳世璠殺於桂林。於是，清軍集中兵力進逼長沙、嶽州，吳三桂聚眾固守。兩軍在江西吉、袁二州、廣東韶關、永興和廣西梧、潯二州及桂林等湖南外圍要地反覆爭奪。清軍將帥每多觀望，曠日糜餉，在軍事上仍處於相持階段。
第三階段
1679年（康熙十七年）八月至二十年十月。1673年（康熙十七年），年已七十四歲的吳三桂在衡州稱帝，國號大周，但未能改變叛軍的困境。同年秋，吳三桂病死，形勢陡變。叛軍無首，眾心瓦解。其孫吳世璠繼承帝位。清軍趁機發動進攻，從此叛軍一蹶不振，湖南、廣西、貴州、四川等地逐步為清軍攻陷。但馬寶、胡國柱等叛軍仍困獸猶鬥，節節頑抗；滿洲將帥仍多遷延，以致時逾兩年，清軍才進逼雲南，康熙二十年底，圍攻省城昆明。吳世璠勢窮自殺，餘眾出降，三藩之亂終告平定。
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歷史影響
清廷在平叛戰爭結束後，沒收藩產入官充當軍餉，撤藩回京師。除吳三桂部調往邊區站、臺服役外，其餘各部重新編入八旗。福州、廣州、荊州派八旗兵駐防，廣西、雲南派綠營兵鎮守，徹底消除了藩鎮制。此外，這次平叛戰爭的勝利，意味著受“三藩”割據之害的人民的解放，給這些地區的社會經濟的恢復和發展提供了必要的條件，從而有利於邊疆和內地經濟、文化的交流。之後，又於公元1683年滅亡了臺灣的明鄭政權。至此徹底消滅了南明的抗清實力。從此有組織的反清復明運動不復存在。此後，清廷開始才建夠開始從事行政和財政經濟的調整改革，然後致力於解決邊疆問題。
這次平叛戰爭的勝利，清除了地方割據勢力，避免了一次清朝分裂，同時中央集權制力量得到加強，提高了抗禦外敵的能力。
吳三桂等人發動的起事，雖然打出了“興明討虜”的旗號，贏得了不少漢人和對滿清朝廷心懷不滿的人支持，得以在短短的時間內席捲長江以南地區，但由於他曾經親手引清軍入關，親手殺害永曆帝，實乃無以自圓，所以並未得到大多數人的支持。再加上其根本目的在於搞分裂割據，起事諸將皆為其朋黨，吳三桂一死，登時土崩瓦解。所以其失敗是必然的。
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