同一塊土地多年種植同一種作物，會出現病蟲害越來越嚴重的情況。如果長期在同一塊土地種植西瓜，則枯萎病、白粉病等會大爆發，這種現象稱為連作障礙。一般來說，前、後茬作物不屬同一科的植物連作，後茬作物很少存在連作障礙。辣椒等蔬菜作物與西瓜不屬於同一科，而且前茬又是露地栽培的，現在採用大棚種植西瓜，應該沒問題。但是，如果那塊地過去多年一直是旱地種植，現在要改成大棚種植，那麼最好先在今秋用水將地浸沒15-25天，這樣做，可以降低土壤的鹽漬度，也可淹死部分地下的害蟲，如線蟲等，使下茬西瓜生長健壯，增加產量。
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