一、職能不同
1、公務員（行政編制）：是指依法履行公職、納入國家行政編制、由國家財政負擔工資福利的工作人員。公務員職位按職位的性質、特點和管理需要，劃分為綜合管理類、專業技術類和行政執法類等類別。公務員主要有黨政機關、人大、政協、兩院（未改革前）等。主要職能與以上單位工作職能相對應。
2、事業單位及事業編制： 事業編制是輔助編制，主要指一些公益性事業單位主要是科教文衛系統，如：公辦義務教育學校、醫療衛生系統（主要指醫院、防疫站等）、廣電、文化系統等社會服務組織。事業單位一般是國家設置的帶有一定的公益性質的機構，但不屬於政府機構，根據國家事業單位分類改革精神，事業單位不再分為全額撥款事業單位、差額撥款事業單位，而分為公益一類事業單位、公益二類事業單位。在事業單位工作的人員稱為事業單位人員，正式編制員工具有事業編制。
二、招錄及管理權限不同
1、公務員的招錄主要有國考和省考，主要各級組織部門人事管理。管理嚴格。
2、事業單位分很多種，有中央、省級、市級、縣級事業單位招錄考試，事業單位的考錄管理沒有公務員管理嚴格，部分省級以上的事業單位有很大的自主權，經主管部門及人事部門批准後可以單獨招考或者聘用。
3、行政單位的管理部門一般為各級黨委政府等，也有二級單位歸口一級單位管理，但相對較少；大部分的事業單位主管部門為對應的行業主管部門，例如衛生系統事業單位的主管部門為衛生行政管理部門
三、工資構成不同
公務員的工資主要由職務工資、級別工資等津補貼構成；事業單位的主要是由技術職稱工資、績效工資等構成。一般來說，相同地區行業同一級別的公務員工資略高於事業單位人員的工資。
公務員工資主要取決於你的職務級別、工齡；事業單位的工資主要取決於你的職務和專業技術水平等級。
四、晉升情況不同
1、公務員職級並行後綜合管理類公務員職級序列分為：一級巡視員、二級巡視員、一級調研員、二級調研員、三級調研員、四級調研員、一級主任科員、二級主任科員、三級主任科員、四級主任科員、一級科員、二級科員。
2、事業單位相比晉升級次少，特別是在既有行政編制又有事業編制的單位（縣級情況比較普遍），事業編制人員晉升的空間就更少。
