儲藏條件可顯著的影響普洱茶的陳化變化，儲放溫度、溼度能夠極其顯著地影響普洱茶感官和理化品質變化的快慢。儲放條件不同，普洱茶的香氣成分和香型的變化差異明顯。因此陳化技術是普洱茶所採用的必要措施，而影響陳化的因素主要有微生物、水分、溫度和溼度等。
微生物
普洱茶與其他茶類相較，除了擁有質量比中小葉種豐富的原料外——提供高濃度反應物，其最大差別在於鍋炒殺青、日照曬乾和有益微生物固態發酵等特殊工藝對其的影響。普洱茶特殊風味的質量形成過程中，微生物佔有極其重要的地位，可以說沒有微生物就沒有普洱茶。
水分
水分是微生物生命活動的必要條件，是細胞內所進行各種生物化學反應的溶媒，也是化學反應的溶劑和黴菌繁殖的必要條件。茶葉的水分含量決定了生長微生物的種類，一般來說，含水分較多的食品，細菌容易繁殖；含水分少的食品，黴菌和酵母菌則容易繁殖。
在儲藏期間普洱曬青毛茶必須增加茶葉含水量，才能使微生物固態發酵發揮較好的溼熱作用，改善茶葉品質。茶葉含水量約為10%，適度的溼度，年平均溼度不高於75%，否則易黴變，應開窗通風，散發水分。
溫度
渥堆溼熱過程中，微生物發育受溫度影響很大，溫度保持在符合微生物生長的範圍內，則微生物大量滋生，微生物分泌酶也會得到加強，且微生物的數量多寡決定分泌酶的濃度與種類，影響普洱茶的氧化方向與後發酵程度。
普洱茶陳化的溫度一般約為25-30℃，溫度不可驟變。溫度太高易加速發酵變酸，影響茶湯水性給予口感的活潑性，甚至形成悶熱，會將原本的生茶，轉變為成熟的普洱茶。
氧氣
茶葉在儲藏過程中，發生的化學變化主要是氧化還原作用，氧氣是不可缺少。氧氣不足時微生物繁殖困難，酶的催化作用難以表達，一則使茶葉內含物的變化不足、滋味平淡、湯色不黃、香氣不高，二則微生物分解同化，茶葉中可溶性糖和氨基酸減少。但氧氣過於充足，也會影響茶葉的內含物過氧化，使葉底烏暗。流通的空氣，含較多的氧分，有利於微生物的繁衍，加速茶葉變化。
光照
普洱茶陳化應注意避光，紅外線使茶葉升溫，紫外線加快光化作用，酚類物質、葉綠素更容易氧化，色澤、滋味變化，失去其原有風味和鮮度。
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