身为岛国的日本，在对外扩张的情况下都必须考虑陆军部队的海上运输以及登陆作战等问题。当时的日本海陆军各自为战，协调不易，因此日本陆军一直希望拥有自己的海上装备。于是，陆军开始营建自己的造船厂，用以建造属于陆军的运输船。截止到日美开战前，日本海军掌握船舶总吨位约有150万吨。而同期，陆军手中掌握的船舶的总吨位就己达到了210万吨。
而且陆军特别成立了称作“晓部队”的陆军船舶兵种，用以管理和利用自己的舰船。而在日本本土的航运方面，两军之间也是从来没有任何的交流协作。双方甚至为了躲避对方，把航运总部都设立在不同的地方。海军的航运办公室在横须贺，而陆军的航运总部在广岛的宇品港。即使这样也并不应该影响双方在情报共享领域的合作，但事实上两军航运总部也从未交换过任何关于船只航行，航路，装载和到达时间等信息。
这种看起来让人感觉啼笑皆非的场面却是日本的常态，当时海军和陆军二战期间都肩负巨大的作战任务，需要大量的武器装备和给。但日本当时的国力不能承担陆海军所需要的资源，以至于在争夺钢铁、石油等资源时更是衍生出更多的现实矛盾。对此，山本五十六曾经一语道破天机：都是陆军太贪婪。
陆海军对石油的需求量和开采量极不平衡，这种不平衡来自于一种奇怪的分配方式，即首先占领当地的军种对占领地区的石油拥有优先分配权。陆军垄断了日本大多数石油资源，但其除了陆军航空队之外，并没有大量需求石油的部门。而其拥有前荷兰属地中85%的石油资源，控制当地最主要的油田，还握有6座大型的炼油厂。〔l〕而海军各类舰艇对石油的需求量极大，而其所占有的石油资源十分有限，海军手中仅掌握婆罗洲的两个港口，并不能供应其所需。因而不得不从被占领的荷属东印度进行大量的开采，但仅仅这样开采也是无法满足海军的用油需求的。
海军长期的石油短缺势必会给其作战中带来不利影响。例如，在1944年6月的马里亚纳群岛航母大空战中，就有一支日本舰队因为燃料不足，被迫停靠在离战场不远处的海岛上，无法对附近的战斗予以有效的援助。由于日本海面舰船受制于石油资源，难以与空中力量形成有效的配合发动大规模地对美攻击。因此，在面对美军全面掌握制空权后，海军便无法再组织有效地进攻。在后来1944年10月进行的莱特湾海战中，也是因为燃料不足，导致两艘战列舰无法从本土赶来增援，最终贻误了战机。自此之后，日本的航母力量彻底被摧毁。
对于这种供需极度不平衡，海军曾扬言要扣留所有发往日本的油轮，并以此来威肋、陆军，企图获得更多的石油资源。陆军对于海军的做法也是嗤之以鼻。随着战争后期日本资源紧缺状况的凸显，两军在石油问题上的分歧也函待解决，日本政府被迫成立了一个陆海军石油委员会，来对石油进行统一分配。但结果可想而知，对于石油委员会所下达的分配命令，双方都不予理睬，实际上的争斗也更加剧烈了。
【1】时代生活丛书，唐其芳译.疯狂的岛国
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