關於扶蘇之死，司馬遷在《史記》中記載的非常明確，秦始皇死後，趙高李斯矯詔，派人送詔書給遠在北地邊疆的扶蘇和蒙恬，密令他們兩人自殺。蒙恬覺得此事蹊蹺，希望上書秦始皇問清原由，但扶蘇認為不需詢問，就此自殺。

扶蘇為人仁，謂蒙恬曰：“父而賜子死，尚安復請！”即自殺。

扶蘇自殺之後，就安葬於上郡（今陝西省綏德縣），墓長三十米，寬六米，高八米，立有石碑一通，上刻“扶蘇墓”三個大字，被譽為“天下第一太子墓”，然而這一結論卻可能被顛覆。

前兩年，英國BBC電視臺與國家地理聯合制作的紀錄片《秦始皇陵的驚天秘密》上線，紀錄片中提到，在秦始皇陵東部，考古專家挖出一個男性貴族的頭顱遺骨，由於埋葬在頭顱旁邊的隨葬品，全是皇家器具，規格非常高。

通過一系列的考古研究，中國不少秦文化考古學家認為，頭顱主人可能就是公子扶蘇。中國秦始皇陵墓遺址高級考古學家李博士，也贊同這一猜測。

客觀的說，頭顱主人是公子扶蘇不稀奇，因為在公子扶蘇自殺之後，胡亥密令有可能讓人將扶蘇頭顱砍下送到咸陽。然而問題在於，這一個頭顱卻極為特殊。

考古確認：頭顱遺骨之後，嵌有一枚弩箭，通過弩箭嵌入骨頭的深度分析，應該是近距離的抵近發射，彷彿是在執行死刑，即頂著後腦勺發射弩箭，與現代處決犯人手法類似！

顯然，按照這一頭顱遺骨的特徵來看，公子扶蘇就不是自殺，而是被人抓住，然後像處決犯人一樣處死。如果是這一種死法，肯定顛覆了《史記》記載。

更深一層的意思是，秦始皇假詔到了之後，公子扶蘇沒有奉命，或許與蒙恬一樣，只是交了手中的權力，並沒有立即自殺，而是讓胡亥手下軟禁了起來。等到胡亥登基之後，才秘密處決了扶蘇。

那麼，存不存在這一種可能呢？

其實，就史書記載而言，並非沒有這一可能。

扶蘇是秦始皇長子，因為敢於直諫，認為天下未定百姓未安，反對實行“焚書坑儒”、“重法繩之臣”（有敢偶語詩書者棄市，以古非今者族）等政策，於是被秦始皇貶到蒙恬手下做監軍。但蒙恬卻是秦始皇信任的大將，手握30萬雄兵，因此看起來這不是貶斥，反而是提升扶蘇，這一點史書記載機智聰明的扶蘇，未必看不透，為何稀裡糊塗的自殺？

更為重要的是，對於扶蘇自殺的一個猜測是，扶蘇熟讀儒家經典，深受儒家思想影響，但當時儒家思想沒有“君要臣死，臣不得不死；父要子亡，子不得不亡”一套，所以是否真說出“父而賜子死，尚安復請”，還真值得懷疑。而且，扶蘇畢竟身處“依法治國”的秦國，不可能完全受到儒家思想影響。

實際上，漢唐之前的中國人，還真鮮有坐以待斃的傳統，往往富有反抗精神，與宋朝之後的中國人可謂截然不同的物種。因此，扶蘇接到不合常理的假詔之後，即便攝於秦始皇威嚴，不敢公然反抗，估計也可能沒有稀裡糊塗的立即自殺，而是像蒙恬一樣交權等待處置。