神聖羅馬帝國（前期）
962 - 1410
神聖羅馬帝國（後期）
1410 - 1806
神聖羅馬帝國 (德意志民族神聖羅馬帝國) 並沒有專用國旗，但是黑色和金色是神聖羅馬皇帝的代表色，並常常被用於他們的標誌：金色的背景上的一隻黑色的老鷹；關於這個標誌的最早記錄為海德堡馬內塞古抄本。在13世紀後期或14世紀早期之後，鷹的爪和嘴被染為紅色（紋章學中被稱做：金底紅爪黑鷹，黑－紅－金三色搭配第一次用在國家標誌上）。15世紀初期開始，雙頭鷹開始被使用。
萊茵邦聯
1806 - 1813
1806年神聖羅馬帝國倒塌，很多前神聖羅馬帝國的邦國加入了由拿破崙支配的萊茵邦聯，其代表了俄國亞歷山大一世及奧地利弗朗茨一世於奧斯特里茨戰役戰敗。其最初成員有16個前神聖羅馬帝國的邦國。當時邦聯使用綠－白－藍三色旗，表示它效忠於其"保護者"，拿破崙一世。
德意志邦聯
1816 - 1848
1816年的維也納會議後德國成立了鬆散組織德意志邦聯, 以團結在1806年神聖羅馬帝國被廢除後餘下的德意志邦國，並以弗朗茨二世為其領袖。這個組織並沒有自己的旗幟，1815年6月12日年由七名本身為呂佐夫志願軍成員同時又是耶拿高級學生聯合會軍隊成員的學生領頭，同其他愛國學生一起建立了耶拿的Burschenschaft。這七個學生選擇黑-紅-金作為學生社團的旗幟顏色，其造型是三條等寬的的紅-黑-紅的橫條組成的三色旗，有金色的流蘇以及在黑色的橫條中間有金色的橡樹枝標誌。
法蘭克福國民議會
1848 - 1853
為了推翻君主制建立共和制的德國，1848年爆發的德意志1848年革命開始使用黑-紅-金三色垂掛旗，在此期間舉行的國家議會將國旗的設計作為討論主題之一。 1848年3月9日，於法蘭克福最終決定開始官方使用黑- 紅-金三色旗。
北德意志邦聯和德意志帝國
1867 - 1918
德國聯邦中最有影響力的普魯士，為了達到其控制整個德國的目的，於1867年建立了北德意志邦聯。 普魯士王國首相俾斯麥私下安排在於1867年7月1日分裂的德國憲法中使用一種新的軍旗和貿易旗：黑-白-紅三色旗。理論上當時德國所有的國際海上貿易是同時屬於普魯士和漢薩同盟的，所以這些商船都應該使用一個統一的既代表普魯士（黑-白）又代表漢薩同盟（紅-白）的標誌。官方解釋為黑-白代表普魯士，紅-白則代表所有漢薩同盟的城市。
在普法戰爭後，其他南德聯邦和北德意志邦聯聯合，於1871年完成了德意志統一，霍亨索倫王朝成為新的德意志帝國的統治者，黑-白-紅三色旗最終於1892年成為德意志帝國的國旗，其一直被使用到1918第一次世界大戰最後帝國的終結日。
魏瑪共和國
1919 - 1933
德國在第一次世界大戰戰敗後於1919年8月14日成立了魏瑪共和國，其再度啟用黑-紅-金三色旗為德國國旗，因為其代表了德國的民主。而原來的黑-白-紅三色旗根據魏瑪憲法代表了君主獨裁製。黑-紅-金三色旗的推行在當時的德國引起了一場國旗鬥爭。 君主主義者和納粹主義者都贊同使用原本的黑-白-紅三色旗並嘲弄黑-紅-金三色旗為„黑-紅-芥末“。
第三帝國（前期）
1933 - 1935
第三帝國（後期）
1933年開始的納粹德國時期納粹主義者將自己黨派的“卐字旗”和舊帝國的“黑-白-紅”三色旗共同作為德國國旗。 阿道夫·希特勒擬定了納粹的很多標誌，卐字旗是他於1920年夏天作出的設計。希特勒認為“這些尊貴的顏色表達了我們對給我們德意志民族帶來了無限榮耀的光榮過去的尊重。”更重要的是“新的旗幟...必須具有如同海報的強大號召力” 因為“成百上千的事實說明一個真正醒目的標幟會成為一場運動成功的第一要素。”希特勒描述道：紅色代表了革命的“社會思想”，白色代表了納粹主義和高尚的純種（希特勒心目中的純種德國雅利安人），黑色的卐字代表了針對世界的“讓雅利安人崛起的戰鬥任務” 。
盟軍佔領下的德國
1946 - 1949
二戰戰敗後，德國遭到盟軍佔領。雖然當時已不存在任何德國政府和德國國旗，德國的船隻在國際法的要求下必需一個國家標誌。由於曾被用作德國的國家標誌，國際信號旗中的C-信號旗被盟國管制理事會作為盟軍佔領下的德國的臨時的國家標誌。其設計為帶燕尾的C-信號旗。理事會規定“這面旗幟不能夠用於垂掛，也不可以掛在任何國家的戰船和商船上，任何人不能對其進行任何致意的儀式。”
德意志民主共和國
1959 - 1990
1946年起蘇聯統治區開始考慮使用黑-紅-金三色旗，並於1948年的第二次人民大會開始對是否啟用黑-紅-金三色旗作為東德國旗開展了討論。這項提議是基於二戰最後兩年的蘇聯的一個反納粹的組織自由德國民族委員會對黑-白-紅三色的使用。根據弗里德里希·艾伯特的提議，1949年10月7日黑-紅-金三色旗正式成為德意志民主共和國國旗。
在1949年到1959年期間，東德和西德的國旗理論上是完全相同的，但從1959年10月1日開始，東德政府在黑-紅-金三色旗的中間加上了德意志民主共和國國徽。在西德方面看來，東德的這個舉動是蓄意加深兩德的分裂，因此在西德和西柏林這個旗幟被稱為“分裂之旗”。
德意志聯邦共和國
1949 - 現在
三基色黑、紅、金和黑、白、紅在德國曆史上都有著重要的意義，也常常獲得不同的解釋。現在黑、紅、金代表二戰後的共和民主政體體制，現在的德國聯邦和自由的聯合體：不僅僅是德國的自由，還包含了德國人民的民主自由。
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