一、創辦機構
日本從小學開始，學校就分為國立學校、公立學校和私立學校。因為日本教育法允許政府、地方公共團體、學校法人創辦學校，所以由日本政府創辦的大學稱為公立大學，如橫濱國立大學;由地方團體創辦的稱為公立大學，如橫濱市立大學;由學校法人創辦的學校稱為私立大學，如早稻田大學。雖然國公立大學和私立大學的創辦方不同， 但是它們都必須經文部科學省批准，接受其領導監督。
二、競爭程度
私立大學有500所左右，佔到日本大學總數的三分之二，國公立大學的數量遠不及私立大學多。並且國、公立大學的教育水準普遍較高，特別是學費低廉，因此，報考人數多，入學門檻高，入學競爭相當激烈，比如橫濱國立大學的專業錄取都是5個以內。作為留學生在報考日本大學的時候，一般都是先報考私立大學，如果有合格校的話，可以作為保底校，再去衝更好的國立大學。如果考得上，私立大學只是損失一筆入學金，超值哦。
三、經費來源
國公立大學的經費主要由國家財政撥款。私立大學的經費主要來源於募捐、財團和學費。私立大學的學費比公立大學要貴2-3倍，國立大學的學費統一為535800， 早大的話大約要130萬，但日本上大學有各種獎學金可以拿，只要你成績好，最後一算賬，我這大學白上了，一分錢沒花，還賺錢了，好膩害。
四、教育質量
國公立大學教學質量高，學費較低廉，學校實力相對均衡，不存在所謂的低水平大學。私立大學需要看學校來區分，學校數量較大，教育質量參差不齊。但其中也不乏在日本乃至國內都非常有名氣的大學，例如：慶應義塾大學、早稻田大學、上智大學、國際基督教大學,GMARCH等。
五、入學方式
國公立大學要報考可選擇日語學校過渡後留學生考試後報考本科，或學部大學院研究生(預科)過度後成為正式生。當然，現在上海或北京等大城市也有EJU的培訓機構或者研究生申請的機構，不去語言學校也可以實現日本留考的培訓和申請日本研究生。不管國立大學還是私立大學都要參加校內考 根據學校和專業不同考試內容而不同。
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