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如果加裝的副電瓶容量沒有超過原車電瓶太多，那麼不需要什麼特殊的方法充電。鉛酸電瓶本身就不是什麼嬌貴的電池，充電也是如此，電壓高一點低一點，電流大一點小一點都沒有問題，只要不長期過充電過放電電池就沒有大的問題。
而且改裝副電瓶都需要加裝電瓶隔離器的，雖然叫做電瓶隔離器，但是並不能真真正的把兩塊電瓶物理隔開、斷開。隔離器只是在車裡啟動後，延遲一段時間後把副電瓶與主電瓶並聯。其意義就是避免發電機因過載、超流而損壞。對於沒有電源管理的汽車，電瓶充電電流大小完全取決於發電機調節器，調節器根據電池電壓來控制勵磁電流大小。從而控制了發電機輸出電壓高低，因此副電瓶如果與原車電瓶直接並聯，那麼車輛啟動後充電電流會非常大。發電機很容易過載損壞，為此電瓶隔離器控制副電瓶 的投入，監測主電瓶電壓，當主電瓶接近飽和後(13.5V左右），才投入副電瓶，與主電瓶直接並聯充電。這樣就避免兩塊虧電電瓶同時充電。
但是副電瓶如果容量明顯高於主電瓶，那麼有必要改裝充電系統。例如主電瓶65ah，加裝了一塊200ah的副電瓶。大容量電池內阻低，同樣電壓下充電電流更大，而且充電時間更長，在副電瓶容量明顯高於主電瓶的情況下(兩倍以上)，即使加裝隔離器也可能導致發電機損壞。
上表可以看出來電瓶容量與內阻的關係。例如65ah電池的內阻＜14毫歐，100ah的電池內阻＜12毫歐，內阻基本接近，同電壓下充電電流差異不會很大。而如果改為150-200ah的電池，那麼內阻降低了1/3左右，充電電流也增加1/3。這就會對原車發電機有影響，尤其大容量電池需要長時間大電流充電。因此加裝大容量電池時要考慮原車發電機功率問題，如果餘量較大那麼可以直接加裝。如果發電機功率餘量不足，那麼就要考慮一下了！
發電機功率餘量不足，可以更換大功率發電機解決充電不足、發電機功率不足的問題。
上圖這種改裝專用的發電機，額定輸出電流160A以上。怠速運轉時可以輸出30A以上的電流，完全可以滿足副電瓶大電流充電的需求。
