約萬年以前齊齊哈爾就有人類生活遺蹟。早在四五千年前的原始社會中華民族的祖先就開發了嫩江流域。
齊齊哈爾站 齊齊哈爾始建城於金朝初。當時齊齊哈爾一帶居住著室韋部。天會三年二月，金太宗把龐葛城分給烏古、敵烈二部。《東北歷代疆域史》和《黑龍江古代簡史》均記載龐葛城即今齊齊哈爾。齊齊哈爾古城址位於今日梅里斯區哈拉古城址。 Image:Yingenmen.jpg 現在的齊齊哈爾城，始建於清康熙三十年(1691年)，齊齊哈爾在達斡爾語中意思是山間的草原。《滿族大辭典》中稱之為“齊齊哈爾清代駐防城”。1665年，清廷在此設卜奎驛站。清政府為抗擊沙俄入侵，清康熙十三年移吉林水師駐齊齊哈爾現齊齊哈屯。康熙二十二年定齊齊哈爾為水師營制，隸屬黑龍江將軍衙門。康熙二十三年於齊齊哈爾設火器營。為了進一步加強防衛，康熙三十年建齊齊哈爾城，是為齊齊哈爾新城。康熙三十八年設黑龍江將軍衙門，光緒二十年（1895年）置黑水廳。
1931年日本侵佔齊齊哈爾。滿洲國成立後，設立龍江省，齊齊哈爾為省會。1936年升為齊齊哈爾市。曾為嫩江省、黑嫩省省會。光復後，齊齊哈爾成為新的黑龍江省省會。1954年黑龍江省會遷往哈爾濱市，齊齊哈爾成為省轄市。
早在一萬年前，已有先民生息、繁衍在齊齊哈爾這塊黑土地上。他們沿嫩江兩岸而居，以漁獵為生。
齊齊哈爾市區轄境，夏商周時期屬索離國；秦漢時為夫餘國屬境；魏晉南北朝時期屬鮮卑和豆莫簍；隋唐時期屬室韋都督府管轄；
遼代屬上京路、東京路；元代屬遼陽行中書省所轄的開元路和水達達路；明朝先歸屬大寧都指揮使司，後屬奴兒干都司。
清初，齊齊哈爾地區屬盛京內務府管轄，不久歸屬寧古塔將軍。
1683年（康熙二十二年）起，改屬黑龍江將軍管轄。
1685年（康熙二十四年），設卜奎驛站，逐步成為黑龍江西部地區諸驛站的中心，並發展為村落。
1691年（康熙三十年），清廷准奏在卜奎站建齊齊哈爾城，並授索倫總管瑪布岱副都統銜，掌管建城事宜。
1699年（康熙三十八年），黑龍江將軍衙門移住齊齊哈爾城。直至清末，黑龍江將軍衙門與齊齊哈爾副都統衙門合署管轄齊齊哈爾。
1905年（光緒三十一年），在省城設黑龍江分巡道極其所屬的黑水廳，管轄齊齊哈爾。次年，裁撤齊齊哈爾副都統。
1907年（光緒三十三年），清政府廢黑龍江將軍，建黑龍江行省，將黑水廳改為龍江府，齊齊哈爾由省垣巡警局和龍江府管轄。
民國時期，1924年，成立黑龍江省城市政公所，管理齊齊哈爾市事宜。
1929年，黑龍江省城市政公所改組為黑龍江省城兼商埠市政局，主管黑龍江省城齊齊哈爾及商埠界內市政諸事，直隸於黑龍江省政府。
1931年“九一八”事變後，日本帝國主義侵佔齊齊哈爾，設置偽滿龍江省，齊齊哈爾仍為省城。
1936年，建立偽齊齊哈爾市公署，隸屬偽滿龍江省公署。此為齊齊哈爾設市之始。
1945年，日本帝國主義投降後，成立民主政權齊齊哈爾市政府，隸屬嫩江省。
1947至此1949年，先後隸屬黑龍江嫩江聯合省、黑龍江省。
1954年，黑龍江省會由齊齊哈爾市遷往哈爾濱市，齊齊哈爾市始為省轄市。
1958年，齊齊哈爾市劃歸嫩江專區專員公署管轄。
1960年，嫩江專區撤銷，其所轄各縣劃歸齊齊哈爾市領導，始行市管縣體制，齊齊哈爾市復為省轄市。
1961年，恢復嫩江地區專員公署，齊齊哈爾市及所轄各縣歸其管轄。
1964年，齊齊哈爾市再次改為省轄市。
1967年，齊齊哈爾市人民委員會撤銷，成立齊齊哈爾市革命委員會。
1980年，齊齊哈爾市革命委員會改稱齊齊哈爾市人民政府。
1985年，嫩江地區行政公署與齊齊哈爾市合併，再次實行市管縣體制，齊齊哈爾市仍為省轄市。
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