上一篇談到，元順帝一逃再逃，逃無可逃，身體也每況愈下，對明軍的作戰也損兵折將。
此後元軍也曾趁明軍回師之際收復上都，但實明軍只是稍作後撤，以重整戰線。與其說是元軍奪回上都，還不如說是明軍為了重新調整戰線而中新主動退出上都。故此直到病故，順帝都始終侍在應昌，沒有能夠重返那曾經盛極一時的上都與大都。
元順帝
洪武三年（1370 )，也是元至正三十年四月二十八日，元順帝終於在愁病交加中死去，享年51歲。在他病故之前的至正三十年正月，順帝已經決定召回擴廓帖木兒，命使者攜帶自己的詔書前往甘肅擴廓帖木兒軍中，希望能夠將分散的兵力重新集結在一起。
明軍也從洪武二年（1369）元軍的反撲中摸清了元軍的作戰意圖，由徐達、馮勝率領西路軍出兵甘肅，直搗定西，阻止擴廓帖木兒東歸；又由李文忠率東路軍出北平，經野狐嶺向上都進軍，既攻打元軍的腹心之地，又可避免應昌、上都一線的元軍向西移動。
西路軍首先發動了沈兒峪之戰。擴廓帖木兒為了奪取西北重鎮蘭州，派兵攻打定西，屯兵車道峪。徐達領兵駐紮在沈兒峪，雙方在此對峙，不斷投入兵力。起初擴廓帖木兒軍略佔優勢，將明軍壓制在沈兒峪谷口，不能前進。但是擴廓帖木兒軍沒有一個穩固的後方，軍心容易浮動。雙方在沈兒峪相持了一個多月的時間，擴廓帖木兒軍心開始出現動搖，陣腳自亂。
徐達經驗何其豐富，見元軍有變，立刻傾全力進攻。結果沈兒峪一戰，北元大敗，擴廓帖木兒只帶了少數親衛向北逃竄，想要避往嶺北行省的和林。行至黃河岸邊，前有黃河之險，後有追兵，擴廓帖木兒幾乎走投無路，只得冒險抱著一棵浮木下了水，渡過黃河，逃至和林。據明軍方面的戰報記載，沈兒峪俘虜北元士兵6萬多人，擴廓帖木兒帳下的漢人主力在此戰之中幾乎消耗殆盡。
李文忠
再說李文忠的東路軍。比起西路軍與擴廓帖木兒的大戰，東路軍面對的阻力則要小得多。順帝直接指揮的部隊數量並沒有多少，部署在山西北部的擴廓帖木兒舊部又在洪武二年（1369）的反攻中損失慘重，很難對明軍構成威脅。
即使如此，李文忠仍然十分謹慎小心，不急不躁，緩緩推進。在東路軍出居庸關之後，二月即進至察罕腦兒，此後在上都周圍與元軍連番交戰，掃蕩上都周圍的元軍勢力，將這一區域的元軍有生力量徹底殲滅。至五月之後，上都至紅羅山一帶均被明軍奪回。
根據《明實錄》記載，李文忠在五月九日攻破開平，即元上都。至五月十三日，明軍嚮應昌挺進的途中，俘虜了一名蒙古騎士。訊問之下，這名蒙古騎士自稱是北元使臣，對明軍交代道“四月二十八日順帝駕崩，我是從應昌來向各地報國喪的。”李文忠反覆審訊，確認情報無誤之後，命部隊日夜兼程，突襲應昌，於五月十五日擊敗元軍最後的一點抵抗力量，並將應昌城團團圍住。
次日，應昌城破，太子愛猷識理達臘之子買的裡八剌被俘，械送北平。唯有愛猷識理達臘率領數十人突圍而出，李文忠追之不獲。
至此北元在應昌地區的勢力宣告瓦解。綿延了近40年的順帝一朝也徹底結束。此後愛猷識理達臘在漠北稱帝，年號為宣光，是為昭宗，北元的歷史又開啟了新的一頁。
下一篇談元昭宗的即位。
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