根文件系統
/bin
這一目錄中存放了供所有用戶使用的完成基本維護任務的命令。其中bin是binary的縮寫，表示二進制文件，通常為可執行文件。一些常用的系統命令，如cp、ls等保存在該目錄中。
/boot
這裡存放的是啟動Linux時使用的一些核心文件。如操作系統內核、引導程序Grub等。
/dev
在此目錄中包含所有的系統設備文件。從此目錄可以訪問各種系統設備。如CD-ROM，磁盤驅動器，調制解調器和內存等。在該目錄中還包含有各種實用功能，如用於創建設備文件的MAKEDEV。
/etc
該目錄中包含系統和應用軟件的配置文件。
/etc/passwd
該目錄中包含了系統中的用戶描述信息，每行記錄一個用戶的信息。
/home
存儲普通用戶的個人文件。每個用戶的主目錄均在/home下以自己的用戶名命名。
/lib
這個目錄裡存放著系統最基本的共享鏈接庫和內核模塊。共享鏈接庫在功能上類似於Windows裡的.dll文件。
/lib64
64位系統有這個文件夾，64位程序的庫。
/lost+found
這並不是Linux目錄結構的組成部分，而是ext3文件系統用於保存丟失文件的地方。不恰當的關機操作和磁盤錯誤均會導致文件丟失，這意味著這些被標註為“在使用”，但卻並未列於磁盤上的數據結構上。正常情況下，引導進程會運行fsck程序，該程序能發現這些文件。除了“/”分區上的這個目錄外，在每個分區上均有一個lost+found目錄。
/media
可移動設備的掛載點，當前的操作系統通常會把U盤等設備自動掛載到該文件夾下。
/mnt
臨時用於掛載文件系統的地方。一般情況下這個目錄是空的，而在我們將要掛載分區時在這個目錄下建立目錄，再將我們將要訪問的設備掛載在這個目錄上，這樣我們就可訪問文件了。（注意在GNOME中，只有掛載到/media的文件夾才會顯示在“計算機”中，掛載到/mnt不會做為特殊設備顯示，詳見自動掛載分區）
/opt
多數第三方軟件默認安裝到此位置，如Adobe Reader、google-earth等。並不是每個系統都會創建這個目錄。
/proc
它是存在於內存中的虛擬文件系統。裡面保存了內核和進程的狀態信息。多為文本文件，可以直接查看。如
/proc/cpuinfo保存了有關CPU的信息。/root
這是根用戶的主目錄。與保留給個人用戶的/home下的目錄很相似，該目錄中還包含僅與根用戶有關的條目。
/sbin
供超級用戶使用的可執行文件，裡面多是系統管理命令，如fsck, reboot, shutdown, ifconfig等。
/tmp
該目錄用以保存臨時文件。該目錄具有Sticky特殊權限，所有用戶都可以在這個目錄中創建、編輯文件。但只有文件擁有者才能刪除文件。為了加快臨時文件的訪問速度，有的實現把/tmp放在內存中。
/usr
靜態的用戶級應用程序等，見下。
/var
動態的程序數據等，見下文。
/usr目錄結構
/usr通常是一個龐大的文件夾，其下的目錄結構與根目錄相似，但根目錄中的文件多是系統級的文件，而/usr中是用戶級的文件，一般與具體的系統無關。
應注意，程序的配置文件、動態的數據文件等都不會存放到/usr，所以除了安裝、卸載軟件外，一般無需修改/usr中的內容。說在系統正常運行時，/usr甚至可以被只讀掛載。由於這一特性，/usr常被劃分在單獨的分區，甚至有時多臺計算機可以共享一個/usr。
/usr/bin
多數日常應用程序存放的位置。如果
/usr被放在單獨的分區中，Linux的單用戶模式不能訪問/usr/bin，所以對系統至關重要的程序不應放在此文件夾中。/usr/include
存放C/C++頭文件的目錄
/usr/lib
系統的庫文件
/usr/local
新裝的系統中這個文件夾是空的，可以用於存放個人安裝的軟件。安裝了本地軟件的/usr/local裡的目錄結構與/usr相似
/usr/sbin
在單用戶模式中不用的系統管理程序，如apache2等。
/usr/share
與架構無關的數據。多數軟件安裝在此。
/usr/X11R6
該目錄用於保存運行X-Window所需的所有文件。該目錄中還包含用於運行GUI要的配置文件和二進制文件。
/usr/src
源代碼
/var目錄結構
/var中包括了一些數據文件，如系統日誌等。/var的存放使得/usr被只讀掛載成為可能。
/var/cache
應用程序的緩存文件
/var/lib
應用程序的信息、數據。如數據庫的數據等都存放在此文件夾。
/var/local
/usr/local中程序的信息、數據
/var/lock
鎖文件
/var/log
日誌文件
/var/opt
/opt中程序的信息、數據
/var/run
正在執行著的程序的信息，如PID文件應存放於此
/var/spool
存放程序的假脫機數據（即spool data）
/var/tmp
臨時文件
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