蒙古與大明對峙期間，並不是全打的復國戰，也就是說並不是以復國為目的的戰爭，他分為兩個階段，其一，北元打復國戰的時期；其二，蒙古分裂內訌時期，某簡單敘述。
北元復國戰時期
自從元惠宗妥歡帖木兒被逐出北京城死在應昌後，他的太子愛猷識理達臘即位，在位的七八年間，一直都懷抱著反攻中原光復中國帝位的希望，併為之努力，但是令他失望的是，到死也沒有復國成功，他的弟弟脫古思帖木兒即位後，繼承了他的復國夢想，繼續為之努力。
對於明國來說，從太祖太宗，對北元的殘部都認真對待，從東、西、南三個方向包圍和壓制。設置泰寧、福餘、朵顏三衛，切斷北元左翼，隔斷他與朝鮮、女真的聯繫；在青海西寧設置罕東、安定、阿端、曲先四衛，招撫西藏，在西域設置赤斤蒙古、沙洲、哈密等衛，切斷右翼，隔斷與西藏的聯絡；並在遼東設立建州、兀者等衛所；明軍從中路出擊，反覆掃蕩大漠南北。
隨著洪武二十一年的捕魚兒海、哈喇哈河戰役，決定了北元的命運，從此，再也不能和明國對抗，復國戰爭再也打不響。
隨著這次的慘敗，脫古思帖木兒被也速迭兒襲擊殺掉，忽必烈系後裔的黃金家族徹底喪失威信，大部分蒙古部落紛紛脫離他而自治，進入蒙古的內訌戰國時代，自此，蒙古的漢文化因素徹底衰退，再沒有年號和廟號的存在。
蒙古分裂內訌時期
這個時期的蒙古四分五裂，黃金家族淪為周天子的地位，群雄爭霸，都想坐坐全蒙古合罕的寶座，甚至不惜向敵對國明國稱臣納貢取得支持，明國的皇帝對於這種狀況很滿意，因為知道這樣會增加蒙古人的內部分裂。
1400年，弒君的鬼力赤被阿速部的酋長阿魯臺和斡亦剌部的酋長馬合謀擊敗，阿魯臺和馬合謀對於蒙古復國毫無興趣，他們希望成為獨立於蒙古部之外的部族，因此選擇嚮明國朝貢，並得到明國的支持，斡亦剌趁機擴張到西蒙古，形成瓦剌；東部蒙古被稱為韃靼。
在明國的支持下，幫助新崛起的瓦剌去壓制忽必烈的後裔們，擴張的勝利讓瓦剌人想恢復成吉思汗的高貴經歷，而明國也為之付出了一些苦果，直到也先的死去，黃金家族後裔的最後一次復辟在達延汗的手中實現，推翻了瓦剌的優勢建立了東蒙古的霸權。
但是隨著達延汗的死，他的兒孫們瓜分了部落，而且分的無比細緻，成為聯邦的形勢，名義上的最高汗察哈爾汗只保留了名義上的領導權，已經徹底墮落成無組織的國家，直到被崛起的女真人降服。
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