新疆地理位置特殊，中原時常不能顧及，所以出現了長期的偏安一隅。新疆的軍閥統治經歷了三個時期：
1912年至1928年，楊增新時期；
1928年至1933年，金樹仁時期；
1933年至1944年，盛世才時期。
楊增新、金樹仁和盛世才
（1）楊增新的守舊
楊增新，雲南蒙自人。光緒年間的進士，在甘肅任職達十幾年。1907年調入新疆，1912年新疆巡撫改為都督，巡撫袁大化覺得自己幹不了，急於脫離新疆，就力推楊增新，北京讓楊做了新疆都督兼民政長。
楊增新鎮壓了伊犁的革命黨人、哈密的農民起義和新疆的哥老會，權力逐漸穩固。他後來採取閉關自守的方針，北京政府鞭長莫及，又把俄國十月革命後竄入新疆的白俄軍分化瓦解，和蘇聯也搞好關係。
他統治的十六年，新疆基本是安定平穩的。當時的軍閥窮兵黷武，但楊增新例外，他認為軍隊夠用就行，多了反而危險，還很花錢，於是沒有擴軍。1920年全省兵員共有一萬幾千人，到了1927年兵員不足一萬。
他不發展軍隊，也不發展工業和教育，整個新疆封閉而緩慢。
用新疆著名社會活動家包爾漢的話說，楊增新喜歡愚民政策，好統治嘛。
楊增新與中外人士合影
1928年，國民革命軍北伐成功，7月1日楊增新宣佈服從南京政府。一週後軍事廳長樊耀南將楊刺殺，因為他認定楊增新是老派軍閥，易幟後繼續當政，新疆就不能有新的改變，於是想取而代之。
樊耀南沒有軍隊支持，當天就被民政廳長金樹仁帶兵殺死，新疆落入金樹仁之手。
楊增新並不斂財，經驗豐富，能在不擴軍的情況下讓新疆長期保持穩定，就此而言，雖然他屬於老派軍閥，但也難能可貴。
（2）金樹仁的無力
金樹仁，甘肅臨夏人。楊增新在甘肅辦過河州書院和甘肅高等學堂，金樹仁從兩個學校畢業，是楊增新的學生。楊增新入新疆，金樹仁應召而往，很受器重，1926年做到民政廳長。樊耀南刺殺楊增新，金樹仁帶兵平息政變，處決了樊耀南，拿到權力。
金樹仁有軍隊支持，因此事成。
他當省主席後改變了楊增新的做法，比如大力擴軍、濫發紙幣和壟斷貿易，軍政上都使用家族和同鄉，結果讓矛盾激化。
金樹仁
1931年，哈密維族起義，維族義軍引甘肅的馬仲英入疆支援，從此新疆不寧。
金樹仁用人唯親，導致很多官員不滿。
入疆的白俄人有戰鬥經驗，他們組成的歸化軍極有戰鬥力，金樹仁欠其軍餉，態度傲慢。
1933年，省軍在外作戰，迪化（烏魯木齊）內部兵力薄弱。4月12日，陶明樾等官員聯合歸化軍政變，成功逼金樹仁下野。
金樹仁的能力遠不如楊增新，幾年時間草草下場。
（3）盛世才的投機
盛世才，遼寧開原人。
他先在日本明治大學學政治經濟，回國後進入軍界，和郭松齡關係密切，郭松齡把義女嫁給盛世才，又推薦盛世才去日本陸軍大學學習。1925年郭松齡反張作霖，盛世才回來幫忙，郭松齡死後又逃往日本。
1927年，盛世才回國，任國民革命軍總司令部上校參謀。
1929年至1930年，任總司令部參謀本部上校作戰科長。
盛世才
1930年，金樹仁派人在南京招攬人才，盛世才找個地方有所作為，就接受邀請進入新疆。開始是督辦公署參謀處的中校參謀，後任上校參謀主任，兼任軍校戰術教官。由於哈密起義和馬仲英入疆，金樹仁派他做軍隊參謀長。
當時的新疆軍官中，盛世才的軍事能力已是上乘。他在軍校很受學生歡迎，帶兵時對軍隊管理比較好，能打勝仗，優待俘虜不擾民，所以名氣越來越大，從參謀長做到東路剿匪總指揮，從而掌握軍隊。
金樹仁漸漸不得人心。
一部分李杜的東北抗日軍從蘇聯境內進入新疆，他們支持老鄉盛世才。
這些都是盛世才成功的基礎。
金樹仁被逼下野，盛世才握有重兵，被選為新疆臨時邊防督辦。南京政府想幹預新疆政治，特使黃慕松聯合推翻金樹仁的陶明樾、陳中和李笑天，但盛世才是個更狠的角色，他立即槍殺陶明樾等三人，使南京的計劃流產。
盛世才隨後將東北義勇軍的高級將領全部處死，以掌握東北軍，又逮捕了歸化軍首領，並取得蘇聯的支持，打敗勁敵馬仲英和伊犁農墾使張培元，奪取了新疆的軍政大權。
盛世才的軍事勁敵
從這裡可以看出，盛世才的作風是：誰能穩固他的政權就投靠誰拉攏誰，誰威脅他的統治就反對誰消滅誰，不管從前是敵是友。
初期，他的方針是聯蘇聯共。向蘇聯借款，請蘇聯顧問和專家到新疆，設立八路軍辦事處，請共產黨員和愛國人士入新疆工作，都是這個階段的事。
1941年，德國進攻蘇聯，蘇聯遭受巨大困難，國民黨掀起反共高潮，盛世才想另找出路，於是開始反蘇反共。當年他製造了一起虛假的陰謀暴動案，將1200多位愛國人士投入監獄。蔣介石高興了，任命他為第八戰區副司令長官。
1942年，盛世才又製造“共產黨陰謀暴動案”，這個案件起因是他的弟弟盛世騏被殺（很多人回憶說其實是盛世才暗殺的），他以此為由，令所有蘇聯顧問、專家和軍隊撤走，然後逮捕全體中國共產黨員，並將陳潭秋和毛澤民等人殺害。
陳潭秋和毛澤民
1944年，蘇聯衛國戰爭勝利，德日法西斯敗局已顯。國民黨加強了對新疆的控制，盛世才為了反抗，又製造了一起陰謀暴動案，把上千名國民黨逮捕入獄，想再投靠蘇聯。結果，蔣介石派兵入新，8月調離盛世才，任其為農林部長。
新疆民眾看盛世才走了，高興之餘，集體控訴盛的罪行。1945年，國民政府撤了盛世才的農林部長，下令查辦，盛世才重金賄賂才解除麻煩。盛世才後來去了臺灣，1970年死。
這個人心狠手辣，不擇手段，而且翻臉如翻書，把國共兩邊都給得罪了，最後沒有死於非命已是運氣太好。回到內地，東北義勇軍的舊部要找他報仇，但他不輕易露面，義勇軍舊部找不到報仇的機會，就去蘭州殺了他岳父全家十一口，震驚全國。
盛世才之後是吳忠信擔任新疆省主席，自此，新疆歸國民黨中央控制。
吳忠信之後，張治中和包爾漢先後擔任過新疆省主席。
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參考書目：
包爾漢：《新疆回憶錄》
周東郊：《盛世才在新疆的特務統治》
中華書局《中華民國史》
