眾源 GPU加速超級計算機實現百億億次計算能力,助力COVID-19研究

Folding@Home 是一個用於蛋白質動力學模擬的分佈式計算項目,為幫助應對COVID-19疫情,該項目通過眾源的方式,實現了超過1 exaflop(每秒1百億億次浮點計算)的處理能力,以幫助COVID-19研究實現突破。

為了更直接地說明該算力有多麼強大,我們以Summit為例進行對比。Summit作為世界上速度最快的超級計算機,擁有27,000多塊NVIDIA V100 GPU,其正式運行時處理能力可達到150 petaflops(每秒150千萬億次浮點計算),在進行HPL-AI基準測試時,其處理能力為445 petaflops。

短短几天,就有近40萬名玩家捐贈了他們的GPU資源來搭建Folding@Home超級計算機。

科學家們將藉助於此計算力進行COVID-19的蛋白質動力學分析,並希望能夠藉此更好地瞭解那些有潛力使病毒失效的藥物如何相互作用。

其中,聖路易斯華盛頓大學(Washington University in St. Louis)的一組研究人員正在研究COVID-19的蛋白質摺疊問題,蛋白質摺疊是蛋白質鏈獲得其固有三維結構的物理過程。

“目前,測定蛋白質結構的實驗方法很多。雖然功能強大,但它們只顯示了蛋白質通常形狀的一個快照。然而蛋白質有很多活動的部分,因此我們更希望能夠看到蛋白質是如何相互作用的,”該組織在他們的網頁中表示:“這些計算需要極大的算力,任何一點支持都可以對研究起到幫助!每運行一次模擬就像是買一張彩票一樣,我們買的彩票越多,中獎的機會就越大。”

眾源 GPU加速超級計算機實現百億億次計算能力,助力COVID-19研究

COVID-19相關蛋白質的示例,通過Folding@Home實現可視化。

Folding@Home項目組表示,該項目是第一個使用GPU進行分子動力學模擬的分佈式計算項目。

該組織表示:“對於某些類型的計算,我們可以看到,相比於基於CPU的同類產品,GPU的速度提高了20-30倍。”

如果你想了解有關Folding@Home項目的更多詳細信息,請點擊“瞭解更多”。


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