工程保通管理费是2018新编办新增加的费用。
一、概念
工程保通管理费是指新建或改扩建工程需边施工边维持通车或通航的建设项目，为保证公（铁）路运营安全、船舶航行安全及施工安全而进行交通（公路、航 道、铁路）管制、交通（铁路）与船舶疏导所需的和媒体、公告等宣传费用及协管人员经费等。
二、内容
工程保通通常情况下分为三种情况：
（1）陆地上保通：主要发生在与其他高速公路及道路交叉处，需要跨越其他道路进行施工，而又不能中断该道路正常运行，需要采取措施进行保通的费用，也就是常说的公路配合费。
（2）水上保通：主要适用于沿海水域、航道等级Ⅲ级及以上的内河水域需要开展通航安全保障的公路工程涉水项目。
依据交通运输部办公厅 2018 年 5 月 10 日发布的《关于印发桥区水域水上交通安全管理办法的通知》，将涉水项目施工期通航安全保障费计入工程建设其他费用中的"工程保通管理费"中 。
（3）跨铁路保通：主要是指跨越铁路时的相关费用。参考案例算法见图。
主要包括
1、安全监测费用：根据铁路部分相关规定，必须在施工期和施工后一段时期内对高铁桥墩的变形、沉降，铁路轨道的位移进行安全监控，确保施工过程中铁路的运输安全。
2、施工安全配合费：为确保铁路行车安全，工程施工期间的费用。
（1）工务部门施工安全配合费
（2）通信、电务、供电部门施工安全配合费
（3）车务部门施工安全配合费
（4）公安部门施工安全配合费
（5）铁路栏栅临时开口费
三、取费方式
1、工程保通管理费仅为保通管理方面的费用。
其他保通措施需要根据保通工程方案另行计算，例如保通便道、保通安全设施、河道占压费等则需要根据设计方案单独计算。
2、2018新编办并规定了涉水项目施工期通航安全保障费计算方法。
具体见编制办法
3、铁路配合费用则需要根据不同铁路的管理权限以及相关规定计算。上文提供的是《广铁集团铁路营业线施工安全管理实施细则》（广运发[2012]310号）相关规定。
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