三藏獸
等 級 ：完全體
類 型 ：僧侶型
屬 性 ：疫苗種
必殺技 ：杜子春經、蝴蝶夢經
為了大徹大悟在數碼世界旅行的僧侶型數碼獸。渡過許多艱苦試煉，將自己身受的日夜苦行視作修行。三藏獸什麼武器都不拿,唸經發出各種各樣的技能。 讓內心頹廢放蕩的數碼獸不斷傾聽感謝的話語使它良心復甦的「杜子春經」。讓敵人浸浴在具現化的三藏獸所受的試煉中「蝴蝶夢經」。分散的念珠從四面八方無限攻擊的幻覺讓見者心挫的「無限彈幕心經」等。三藏獸的數碼核為了大徹大悟積攢著必要的清純能源，傳聞將其數碼核奪為己用能治癒任何傷勢和大病，得到永遠的生命，被慾望驅使的數碼獸們，常常伺機而動。但是被三藏獸吸引的不只有敵人，也有抱持各種煩惱而焦慮的數碼獸們。據說其中尋求答案和真實的，愛慕三藏獸，在一起共同旅行著的數碼獸也存在著。
悟空獸
別 名 ：孫悟空獸
等 級 ：完全體
類 型 ：獸人型
屬 性 ：病毒種
裝 備 ：如意金箍棒
必殺技 ：疾風迅雷擊
他的名字和設計均派生自中國古典小說《西遊記》中的孫悟空。
從啟動火山煮得翻滾的岩漿中誕生的悟空獸，是為了追求強大以大量數據庫為雛形提取數據的結果、誕生出覺醒鬥爭本能的戰鬥型數碼獸。遵從內心深處挑戰強敵的渴望在數碼世界旅行著,與判斷強大的對手遭遇，會傲慢無禮的隨處提出戰鬥。但是悟空獸誕生時被三藏獸在頭上安了「緊箍兒」，每當罵人過度，就會因為頭部被勒緊而痛苦的暈倒，勉勉強強遵守著禮儀。悟空獸擅長許多武術·妖術，手上拿的「如意金箍棒」可伸縮自如，分離了也能給了敵人打擊，連接狀態可以放出雷光炮，分成兩把手槍能打出雷光彈是萬能武器。輕鬆的使役「如意金箍棒」用特技動作愚弄敵人「秘技·夢現影」施展像被眾多悟空獸攻擊一樣的殘像攻擊。在地面插上「如意金箍棒」飛馳到高空雷雲上，自身積攢雷電能源，像落雷一樣衝撞的「疾風迅雷擊」。增幅在「如意金箍棒」內部的能源，放出「超帶電雷光炮」
釋迦獸
等 級 ：究極體
類 型 ：如來型
屬 性 ：疫苗種
必殺技 ：悟遍路掌
傳聞在數碼世界最接近於世界樹的存在，釋迦獸從古代時就守護著數碼世界東方。是充滿慈愛的存在，為作進一步提升時數碼世界會給予試煉。那試煉也帶有釋迦獸的慈愛，據說釋迦獸一直等待著克服試煉的數碼獸到來。向知曉天上天下之理得釋迦獸挑戰是無意義的事情。就算挑戰了也只會永遠處於釋迦獸的掌上把幻覺當做對手，致使心力耗盡。通過「悟遍路掌（遍路：朝聖）」釋迦獸領悟了爭鬥是無意義的。還有，用閉眼也無法遮掩住的圓光照射對手淨化邪惡將其救濟的「靈光蜘蛛絲」、「怠條真言」大喝一聲挫敗敵意，將敵人吹飛到彼方。
鳳凰獸
其他名稱 ：聖鷹獸、菲尼克斯獸
等 級 ：究極體
類 型 ：聖獸型、聖鳥型
屬 性 ：疫苗種
必殺技 ：星光爆破
擁有四張閃耀金黃色翅膀的神聖數碼獸。據說是所有鳥型數碼獸之長，神聖係數碼獸統治者。正對應獸型數碼獸的終極形態聖龍獸，鳳凰獸是鳥型數碼獸的終極形態。擁有神聖係數碼獸的證明，兩個激發神聖力量的「神聖環（Holy ring）」，從這點就可以理解鳳凰獸擁有不可估量的力量。必殺技是拍打神聖的四張羽翼，傾降金黃色粒子的「星光爆破」。據說受到此技能攻擊，所有罪惡都會被淨化。
聖龍獸
等 級 ：究極體
類 型 ：聖龍型
屬 性 ：自由種、疫苗種
所 屬：四大龍
必殺技 ：聖潔烈焰
神獸數碼獸的終極形態，其雄壯的英姿讓人覺得是天空的王者。其身姿很少有人看到，一般就連在哪裡都完全不能弄清楚。不過，傳說一旦數碼世界發生了巨大邪惡能量的話就會從某處無意中出現，憑藉其巨大的力量將邪惡歸為虛無。必殺技是將一切正義的光能量撞向對手的「神聖烈焰」。受到此技能攻擊者身體一瞬間被化為灰燼。
神龍獸
等 級 ：究極體
類 型 ：聖龍型
屬 性 ：疫苗種
所 屬：四大龍
擁有六張硬質化的羽翼，身體閃耀金黃色光輝的神龍型數碼獸。手臂上帶有神聖係數碼獸的證明——神聖環（Holy Ring），因此被認為是神聖係數碼獸之一。神龍獸是「四大龍數碼獸」之一，四大龍數碼獸目前確認有聖龍獸和神龍獸兩隻。另外，神龍獸右手和左手袖套分別封印著掌管「破壞」的名為「紅炎之阿獸」和掌管「再生」的名為「蒼雷之吽獸」這兩隻小型龍數碼獸。必殺技是讓神聖之氣爆炸，將全方位敵人一瞬間掃蕩的「神之烈焰」。
黃龍獸
等 級 ：究極體
類 型 ：神獸型
屬 性 ：數據種
必殺技 ：太極、黃回
別 名 ：皇龍獸
統治著守護數碼世界東西南北的四聖獸，鎮座中央掌管「大地（世界）」的皇帝數碼獸。由於在遙遠的古代降臨的一隻天使數碼獸而被封印於地下最深處的黑暗之中。因此失去統治的四聖獸開始爭奪霸權，如今才保持著這樣的均衡。其存在亦善亦惡，被稱為光與暗的「太極」。擁有8隻眼和身體外的12個「數碼核」，其巨大身體被以絕對硬度著稱的特殊礦石「黃龍礦」之鱗所覆蓋，想對他造成一點傷害都是不可能的。必殺技是持續將數碼世界的萬物永遠分解為光暗兩極，不久便化為烏有的「太極」，以及掀起自然災害規模的巨大砂土流颱風的「黃回」。
四聖獸
四聖獸是守護數碼世界東西南北各個方位的四個究極體聖獸型數碼獸，他們擁閃耀的4隻眼和12個數碼核，擁有如神般的力量。
十二神將
十二神將（十二帝魔）是以干支為原型的12個完全體數碼獸，他們為四聖獸服務。
他們都是完全體、聖獸型數碼獸。受四聖獸節制，而四聖獸中的每一位支配十二神將中的三位天神。形態和名字分別來源於中國的十二生肖和十二位佛教護法神祇。
毗羯羅獸(亥豬)、宮毗羅獸(子鼠)、伐折羅獸(丑牛)、迷企羅獸(寅虎)、安底羅獸(卯兔)、摩仁羅獸(辰龍)、珊底羅獸(巳蛇)、因達羅獸(午馬)、波夷羅獸(未羊)、摩虎羅獸(申猴)、真達羅獸(酉雞)、招杜羅獸(戌狗)
麒麟獸
據說是在數碼世界創生之時誕生的古代數碼獸，作為完全體以匹敵究級體的力量而為傲，是傳說中的聖獸型數碼獸。
等 級 ：完全體
類 型 ：聖獸型
屬 性 ：疫苗種
必殺技 ：疾風天翔劍
據說是在數碼世界創生之時誕生的古代數碼獸，作為完全體以匹敵究級體的力量而著稱，是傳說中的聖獸型數碼獸。傳說該數碼獸擁有強大的力量，卻極度厭惡爭鬥，絕不進行殺戮之事。憐愛數碼世界一切生命的大慈大悲的性格，不過對於毫無緣由進行殺生的行為，也會施以毫不留情的制裁。必殺技是從高空一口氣俯衝下來，用頭部的角貫穿敵人的「疾風天翔劍」，以及用敏捷的動作施展分身攪亂對方的「迅速之心得」。另外，麒麟獸放出靈氣，一旦展翅之時，會放出引導敵人向聖道的「改心之波動」。
豬八戒獸
等 級 ：完全體
類 型 ：玩偶型
屬 性 ：數據種
必殺技 ：強振炮舞亂
穿豬豬裝的女性型數碼獸。原來是天使係數碼獸,但是因為幹壞事，觸了座天使獸的逆鱗，而被放逐出天界，變成了豬的模樣。平常很樂天，就算模樣變了也不介意，非常明亮的性格,但肚子越空就越焦躁、變化為兇猛的性格。當完全空腹，下手就會毫不留情。武器的「爐傑塔釘耙（rocket 釘耙）」具備推進器，加上豬八戒獸的怪力，威力巨大。加速力全開，全力打擊的「強振炮舞亂」將敵人吹飛到遙遠的彼方。「打打打魅飲血」讓對手浸浴在「爐傑塔釘耙」的高速連打下、被打扁的慘不忍睹。還有用因空腹而憤怒熊熊燃燒的自己身體抱住對手的「豬丸燒」會恰到好處地燒掉對手。因為想改掉兇猛的性格，主動進行著革心之旅行。
沙悟淨獸
等 級 ：完全體
類 型 ：魔人型
屬 性 ：病毒種
必殺技 ：月牙斬
從數碼世界的天界被放逐的魔人型數碼獸。平時沉著冷靜，不過據說封印著某個數碼核的首飾中九個缺掉一個的話，就會再次變化為可怕的數碼獸。必殺技是輕輕旋轉驚人的超重量級杖「降妖寶杖」激起水龍捲「降妖寶杖·渦紋之陣」，以及扔出杖放出擊碎大地的激流「降妖寶杖·瀑布之陣」。另外，還有接近戰的時候使用新月狀的刃進行突刺的「月牙斬」。
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