1231年，窝阔台在对金国发起全面进攻的同时，派撒礼塔出兵高丽。这是蒙古第一次入侵高丽。撒礼塔攻陷了高丽新镇（义州）、铁州（铁山）等四十多座城池，高丽将领洪福源降蒙。
1232年正月，蒙古再次兵分两路攻打高丽的龟州和静州，高丽请和，蒙古留下七十二名达鲁花赤和一些守备队后撤兵。
1232年八月，撒礼塔在降将洪福源的配合下攻入高丽，占王京南处仁城，被高丽僧金允候击退。
1235年，窝阔台命唐古拔都尔与洪福源出兵高丽。两年的时间里，席卷高丽半壁江山，但对于迁都在江华岛的高丽王，却始终无法给予致命一击，在高丽王献贡请和之下退兵。
1247年，因高丽拒绝纳贡，又不肯迁都回陆上，贵由汗命阿母罕与洪福源攻占威州平虏城。不久，因贵由去世，蒙古撤军。
1252年十一月，蒙哥命也古为征东元帅，与洪福源再征高丽。虽然在陆上蒙古军队所向披靡，但七拼八凑出来的水师却完败于高丽大将李广。
在忽必烈之前，蒙古一共发动了六次对高丽的战争，虽然一度占据高丽的大半领土，但始终无法让高丽彻底降服。高丽的对付蒙古的方法其实很简单，他们抛弃陆上所有的城池与子民，任由蒙古掳掠与欺凌。纵横于陆上的蒙古军团，此时没有任何的水师配备，高丽凭着实力超过蒙古的水师，死守江华岛，以保王室不失。
而对于这片贫瘠的高丽土地，以掠夺为主业的蒙古人，根本没兴趣也没办法去治理。便如割韭菜一般，每过两三年就过来割上一茬，然后施然离去。
高丽国土虽然因为蒙古人的屡次入侵而惨破，国民被掳掠无数。但高丽王室依旧存在，因此也不算亡国。
1259年3月，高丽与蒙哥汗的蒙古政权终于达成和议，太子王倎带着国书去四川，朝觐正在攻宋前线的蒙哥。但是走到半路，却得到了蒙哥死于战场的消息。迷茫的王倎只好改道准备回国，路经汴梁时碰到从鄂州北撤的忽必烈，于是跟着他到开平，开始跟随忽必烈的脚步。第二年三月，高丽国王去世消息传来，忽必烈派兵护送王倎回高丽，即国王位。同时颁布了赦免高丽国境内的制书，又授予王倎封册、虎符和高丽国王印。还发布诏令撤回驻高丽境内的蒙古军队，归还被掳掠及逃离的高丽百姓。
这次合作，忽必烈与王倎各取所需，合作愉快。王倎依靠忽必烈的力量，顺利登上高丽王位；忽必烈则利用王倎的顺服，从阿里不哥手中截获了对高丽的控制权。
1264年，改名为王禃的王倎以内属国国王身份觐见忽必烈，正式承认其宗主国身份。
1269年（至元六年）六月，高丽权臣林衍、林惟茂父子击败金仁俊，立王禃弟安庆公淐为王，控制了高丽军政大权，同时对蒙古开始采取强硬态度，以抗蒙的名义来稳定自己的权力。
1270年四月，在忽必烈发兵支持下，高丽王室的亲蒙派终于击垮林惟茂，结束了高丽近百年的武臣政权，王禃重新获得王位。这次，高丽王室再不敢违抗忽必烈的旨意，拆毁了江华岛内城，正式把都城迁回陆地。同时解散了江华岛的主力防卫部队“三别抄军”（左别抄、右别抄、神义别抄）。
三别抄因此以抗蒙名义发动暴动，将全罗道的珍岛作为根据地。在高丽水军的协助下，蒙古与高丽组成“讨伐军”，在1273年四月，终于歼灭别抄军。高丽国内的反蒙势力基本被肃清。
高丽“三别抄”军
虽然与高丽王室已经结下了不薄的战斗友谊，但忽必烈对高丽的影响还是有限。于是，他采取另一特殊的方式来控制高丽，在高丽王屡次“请求”赐婚之后，他将13岁的皇女忽都鲁揭里迷失下嫁高丽世子王愖。在忽都鲁揭里迷失到达高丽后，王愖的前妃被降为贞和宫主，自此被打入冷宫。1274年七月，王禃去世，忽必烈诏令世子王愖继国王位，忽都鲁揭里迷失便成为高丽国王后。
自此，高丽与元朝结成了政治联姻，并形成元朝的定制：凡高丽国王尚蒙古公主者，一律授“驸马高丽国王”。也就是说，任何高丽王子想成为国王，首要的条件得娶个蒙古公主回家供着。蒙古公主在高丽的地位也极其显赫，不仅可以参政，许多高丽国事，都是身为王后的蒙古公主说了才算。这就意味着高丽国王，如果想对付蒙古的话，首先得过了老婆这一关。
通过这种独特的方式，元朝牢牢地控制着高丽国的军政大事。
忽都鲁揭里迷失
历史上，中原政权与外部政权的联姻，基本都是以“尚公主”形式进行和亲。中原皇帝把女儿嫁出去后，基本是管不了的。无论这个女儿是生是死，甚至再嫁给自己的继子，都无法过问插手。真正所谓是“嫁出去的女儿，泼出去的水”。
但是忽必烈凭着强大的军事压迫力，却把嫁出去的女儿扶持成高丽的权威。而且逼迫着每一任的高丽国王必须具备蒙古的血统。以此，基本杜绝了高丽国内的反元事件，使高丽被改造成为由元朝严密控制的真正“内属国”。
不过，即便是保持着与高丽国表面上的联姻，忽必烈对于高丽，还是一直持着蔑视态度。他曾立下“贱高丽女子，不以入宫”的“世祖皇帝家法”（元史·顺帝纪四）。
除了以公主来控制高丽王室之外，忽必烈还在高丽国内培植忠元的军事势力。
蒙哥时，曾要求高丽王子入质。当时的国王王瞰将清化侯王璟之子王綧认为义子，入质蒙古。忽必烈上位后，将长期居住于蒙古的王綧任命为高丽新附军民总管，统领元朝境内的高丽归附百姓。王綧先是随忽必烈军讨伐李璮叛乱，又随蒙军回高丽平定国内叛乱。之后，还参与了渡海征日、征伐乃颜的战争。为了对蒙古人表其忠心，王綧甚至将自己的三个儿子全部改为蒙古名字。
另一个颇代表性的是洪茶丘。洪氏之祖是唐末移居高丽的中原人氏，洪茶丘之父洪福源是最早降蒙的高丽将领，曾多次配合蒙古军队入侵高丽。洪茶丘袭其父官职后，相继担任东征右副都元帅和都元帅，与王綧一起掌管高丽归附蒙古的百姓。此人一生勤恳，为协助元朝平定高丽国内叛乱而不懈努力，是忽必烈遏制高丽王室权力的忠实干将。
1277年正月，忻都与洪茶丘又平定了高丽大臣金方庆的叛乱。自此，高丽国内的反元势力彻底灭绝。高丽王室以其独特的方式表达了对元朝的忠诚，元朝也肆无忌惮地在高丽国土上予取予得。在忽必烈连续发动的两次攻日之战中，高丽付出了巨在的人力与物力，自此之后，高丽再无力对元朝产生出丝毫的抵抗之心。双方彼此和谐的关系也一直存续到了元朝灭亡之时。
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