獸藥原料的使用缺點：
1.計量不便
直接使用獸用原粉，需要確切知道畜禽的喂料量或飲水量，並能換算成每隻畜禽的使用量，需要知道這種藥在這種畜禽體內的藥動學參數，以及這種藥的折純換算等，而這些關鍵點一般獸醫人員都難以把握，更何況一般飼養戶。
2.混合不均
獸用原粉直接飲水或拌料使用，很容易混合不均，這也是國家禁止將獸藥原料直接使用於養殖場的原因。混合不均則達不到治療效果甚至會
3.生物利用度不高，導致浪費
藥物的給藥途徑有多種，而口服給藥要經歷消化道酸鹼作用、微生物作用、消化酶的作用、食物成分的影響以及吸收後肝臟的首關消除，因此，生物利用度較低。
4.使用不便，多數原粉不能飲水給藥
家禽給藥的主要途徑是飲水，但是目前除蛋禽和某個階段的種禽還在使用粉料或自配料外，其他基本上都在使用商品顆粒料，因此養殖場不便於混飼給藥。而飲水給藥又不適合於所有的藥物，例如有些藥（如青黴素）在飲水中不穩定，會很快水解；有些藥（如氟苯尼考）不溶於水，需要通過特殊的工藝做成溶於水的製劑，因此原粉飲水給藥受到許多限制。
5.口服不吸收
有些藥可溶於水，但口服不吸收，如氨基糖甙類、某些頭孢菌素類，口服吸收有限，只能用於治療腸道感染，而不能用於治療全身感染。如果要治療全身感染則必須改變給藥途徑。
6.適口性不好
獸用原粉直接飲水給藥時，有些味覺敏感的動物（如豬）會不喝，家禽由於味覺不敏感一般問題不大，但也有些藥兌水後，禽類也出現飲水量大幅下降的現象。如果將原粉通過特殊的工藝製成製劑，可以掩蓋其不良味道，從而改善適口性。
禁止使用獸用原粉的原因
1.國家法律法規不允許
《中國人民共和共獸藥管理條例》明文規定不準飼養場直接使用獸用原粉，也不準獸用原料藥和人用原料藥生產單位將藥物原料銷售給獸藥生產企業以外的單位，如飼料加工廠、畜禽飼養場。飼料廠在飼料中添加的藥物，必須在法規規定的範圍內，且必須添加經獸藥廠加工成的製劑，如1%的馬杜拉黴素預混劑。
2.獸用原粉摻假現象嚴重
一些獸藥經銷單位將獸藥原料銷售給飼養場，開始時供應的是純粉，但過一段時間，當知道飼養場並不具備鑑別條件和鑑別知識時，遂向獸用原粉中添加一些可溶性的輔料（如葡萄糖粉），導致飼養場購進的獸用原粉質量參差不齊，某些獸藥含量甚至不到一半，效果時好時壞。
3.獸藥的復配需要較高的技術知識
目前畜禽疾病混合感染較為普遍，在臨床上治療疾病使用單一藥物往往不能很好地解決問題，大多需復配用藥，而復配用藥需要有一定用藥經驗的獸醫師才能做到，即使在一些規模化養殖場也不能完全具備。
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