故事的一開始白色要塞號(White Base)偷摸進入SIDE7一號殖民衛星。艦上，聯邦的高達設計者，提姆·雷大尉正要與兒子阿姆羅重逢。但是夏亞·亞茲納布爾麾下的士兵駕駛著三臺扎古潛入了衛星，發現聯邦竟然有了MS！
吉恩士兵受到驚嚇，決定摧毀聯邦的MS。但是誰也沒想到，躺在板兒車上的RX-78-2高達，竟然站起來了！高達屹立於大地！
啟動78的就是提姆·雷大尉的獨子——阿姆羅（騾子），騾子的技術宅優勢充分發揮，在首戰中就展示了gundam的強大技能，幹翻兩架扎古，一舉成名，成為了王牌機師。因此，也展開了騾子與夏亞（鴨子）十五年宿敵關係。
雖然阿姆羅一上來就開啟了主角光環，但還是未能挽回某些損失，例如，因捲入戰鬥而缺氧致殘的提姆·雷大尉（後定居SIDE6）；白色要塞原艦長保羅，重傷身亡，因此年輕的布萊德·諾亞繼任艦長，代理領航員米萊（千斤大小姐、後為布萊德夫人），候補機師隆，吃瓜少年隼人、凱。幾乎全是年輕成員，然後開啟了年輕人逆襲成長的故事，因為遭到夏亞與卡爾瑪·扎比（吉恩地球方面軍總司令）的追擊圍剿，白色基底開始突圍。經歷月神Ⅱ戰鬥，向地球南美洲的加布羅要塞前進。
因為是年輕人非正規軍，騾子也有罷工的一天，布萊德艦長怒氣值暴增賞了阿姆羅一巴掌。然後，騾子怒氣值繼續增加布萊德艦長，又被賞了一巴掌。然後就誕生了著名的林有德修正拳：“連我爸爸都沒打過我！！”
10月4日，布萊德艦長設計扼制夏亞軍，被夏亞所察覺發現，但夏亞故意讓卡爾瑪中計，開啟了“夏亞你算計我！”的時代梗。
夏亞並非無緣算計友軍，他其實是吉恩·茲姆·戴肯（遭扎比家族毒害）之子，原名卡斯巴爾·雷姆·戴肯，陷害卡爾瑪（扎比家四子）就是向扎比家復仇的計劃之一。夏亞在匿名後長期不露真面目，就是要掩飾其真實身份（也開啟了高達之中必有面具男的元素）。
卡爾瑪死後，吉恩公國坐不住了，基連·扎比（扎比家長子）於10月6日公開演說，擴大戰事為卡爾瑪復仇。
同月，聯邦的RGM－79吉姆開始量產，吉恩公國也投入更多的新型MS投入戰場（可以賣一波玩具了），而且也開始研究NEW TYPE。
隨著強敵接連不斷，尤其是“青色巨星”蘭巴·拉爾（老虎駕駛員）的影響、還有家庭、個人心智還不夠成熟的種種影響下幾近崩潰（阿姆羅還是個孩子！）。然而，作為一部長番，主角的成長是必不可少的。與此同時，阿姆羅因為是NEW TYPE而受到重視（畢竟是主角）。
11月7日，聯邦軍開始了長達3天的作戰，計劃奪回俄羅斯地區（戰鬥民族：啥？）的奧德賽（馬里奧：啥？），著名的黑色三連星登場，然後被騾子打敗。加上加布羅的戰鬥也被聯邦取勝，聯邦開始逆轉。
12月14日，聯邦直逼吉恩本土（星1號作戰）
15日，對北美、非洲公國軍掃蕩；
24日，聯邦在宇宙所羅門開戰，但是吉恩的落敗已成定格，巨型MA-08 大扎姆登場掩護吉恩友軍撤退，駕駛員：多茲魯中將（扎比家三子，宇宙方面司令官），最終被阿姆羅戰敗身亡。
12月30日，德金公王準備與聯邦軍進行和平會談，但是！戰爭番必須有不同意休戰的人存在，破壞和平會談。基連·扎比（吉恩總帥）使用SIDE3的吉恩最終防衛武器“太陽系統”——衛星激光炮發動了攻擊，射出超級光束，自己的父王德金在內的友軍、敵軍全部摧毀。
聯邦軍怒了，次日對吉恩的最終防線阿·保亞·庫發動了全面攻擊，因為基連·扎比殺害了父王，基西莉亞少將（扎比家長女）其射殺基連，然後親自指揮吉恩軍，但最終失敗。
在最終戰中關鍵人物：拉拉·辛
拉拉·辛是夏亞小時候收養的一名印度血統少女，天生的NEW TYPE，此戰中也是伴隨夏亞來到戰場。因為同是NEW TYPE，拉拉與阿姆羅的精神場產生了共鳴（神交），與騾子成為知己。三角關係由此展開：一位是知己，一位是恩人；同時拉拉對於騾子&鴨子都是地位極高的人物。最後，阿姆羅開著高達用光刀誤插了拉拉的戰機，然後騾子和鴨子都瘋了……
最後勸解兩人的是塞拉（白色要塞女士官）(小說中與阿姆羅滾過床單)，而且她還是夏亞失散多年的親妹妹，塞拉將兩人拉回理性，阿姆羅與白色基底脫離戰場，夏亞則繼續他的對扎比家的復仇計劃。
0080年1月1日，聯邦與吉恩在月面格拉納達基地簽訂停戰協定。
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