別再叫它“垃圾”了——這個“跳躍”基因可能就是胚胎髮育的關鍵

在你生命中的某個時刻,你還是個雙細胞胚胎,正翻著跟頭進行子宮“軟著陸”。一項新的研究表明,能完成這個基礎過程還要多虧了一種 DNA,而該 DNA 曾一度被諸多科學家當作“垃圾”。

康奈爾大學的 Cedric Feschotte 並未參與此項研究,但他表示:“這篇論文真是讓人印象深刻”。

人體中成千上萬的基因只佔了其基因組的一小部分。在其中較為常見的是被稱“跳躍基因”的DNA 序列——轉座子。這是因為這種 DNA 序列可以將其自身的拷貝重新定位或導入基因組中的不同位置。我們大約有一半的 DNA 由轉座子組成,研究人員一度認為它們是“寄生蟲”基因組,雖然可以進行自我複製,但對“宿主”沒有任何作用。

別再叫它“垃圾”了——這個“跳躍”基因可能就是胚胎髮育的關鍵

圖丨雙細胞階段的胚胎需要一個不尋常的移動 DNA 序列來保持其發育

然而,現在,科學家們認為這些序列對生長髮育至關重要。研究人員發現,大約 25% 可幫助開啟或關閉基因的調控序列包含一些轉座子,這意味著它們所提供的 DNA 已為我們所用。也就是說,通常情況下,轉座子表現得像是個“不速之客”。例如,當一個轉座子闖入基因組中的新位置時,它就像是找到了一個“宜居之所”,但是它也可能引起致癌的突變。

發育生物學家 Miguel Ramalho-Santos 及其同事想要確定在胚胎髮育的過程中,轉座子 LINE1(占人體 DNA 的 17%)是一無是處還是有所貢獻。在複製過程中,LINE1 首先產生自己的 RNA 拷貝。隨後,酶將該 RNA 轉化回 DNA,插入基因組某處。“這種轉座子令人迷惑不解",Ramalho-Santos 說。因為這發生在胚胎髮育的早期,這時候 DNA 的改變可能變為一場災難。通常情況下,細胞會抑制轉座子,但在胚胎早期,細胞則似乎放任其發展。“是細胞瘋了嗎?它們在玩火嗎?還是有什麼我們不知道的東西呢?”他問道。

別再叫它“垃圾”了——這個“跳躍”基因可能就是胚胎髮育的關鍵

圖丨轉座子(發光點)在這種雙細胞小鼠胚胎中普遍存在

Ramalho-Santos 及其同事找到了一種縮短 LINE1 跳躍機制的方法,並將這個問題付諸試驗。研究人員設計了阻斷了其複製過程的小分子,將細胞中 LIN1 RNA 的量減少了 80%~90%。隨後,科學家們測試了被束縛的 LINE1 在小鼠胚胎幹細胞中的作用。雖然這些細胞分裂產生專門的體細胞,但它們仍需要產生更多的胚胎幹細胞,以供繼續發育。研究小組發現,去除 LINE1 的 RNA 顯著降低了細胞的自身補充能力。

在自然的胚胎髮育中,LINE1 還有另一個獨立的功能。該團隊在最新的《細胞》雜誌中報道稱,當 LINE1 RNA 缺乏時,小鼠胚胎將停滯在雙細胞階段。人類胚胎在著床於子宮壁之前,就已經到達了這一階段。如果胚胎不能突破這個階段,就不會發展為一個個體。

科學家報告稱,儘管轉座子因能插入基因組而聞名,但 LINE1 的胚胎作用與這種能力無關。相反,轉座子的 RNA 與兩種蛋白質結合,可使雙細胞胚胎繼續發育。

研究結果表明,LINE1 轉座子在胚胎中也有好的一面,Ramalho-Santos 說:“它們不僅僅是自私的“寄生蟲”,同時對於我們人體來說,它們是內源的。沒有它們,也就沒有我們。”Feschotte 說,通過協助宿主細胞,轉座子也實現了其自私的目的。“看來這是發育的必由之路,人們無法擺脫。”

然而,一些研究人員也對這項研究結果持懷疑態度。約翰·霍普金斯大學巴爾的摩醫學院的分子人類遺傳學家 Haig Kazazian 指出,大約有 50 萬份 LINE1 的拷貝遍佈於我們的基因組,其中很多都在基因內。他說,技術研究人員在阻斷 LINE1 RNA 產生的同時也可能會關閉這些基因。因此,科學家觀察到的影響可能是由於這些基因失活,而非LINE1 RNA 減少。“在早期發育中,你可能在敲除某些關鍵基因。”他表示。


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